Protein–RNA interactions for Protein: Q9DAP7

Asf1b, Histone chaperone ASF1B, mousemouse

Predictions only

Length 202 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Asf1bQ9DAP7 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Asf1bQ9DAP7 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Asf1bQ9DAP7 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Asf1bQ9DAP7 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Asf1bQ9DAP7 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Asf1bQ9DAP7 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Asf1bQ9DAP7 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Asf1bQ9DAP7 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Asf1bQ9DAP7 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Asf1bQ9DAP7 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Asf1bQ9DAP7 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Asf1bQ9DAP7 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Asf1bQ9DAP7 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Asf1bQ9DAP7 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Asf1bQ9DAP7 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Asf1bQ9DAP7 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Asf1bQ9DAP7 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Asf1bQ9DAP7 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Asf1bQ9DAP7 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Asf1bQ9DAP7 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Asf1bQ9DAP7 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Asf1bQ9DAP7 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Asf1bQ9DAP7 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Asf1bQ9DAP7 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Asf1bQ9DAP7 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Asf1bQ9DAP7 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Asf1bQ9DAP7 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Asf1bQ9DAP7 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Asf1bQ9DAP7 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Asf1bQ9DAP7 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Asf1bQ9DAP7 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Asf1bQ9DAP7 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Asf1bQ9DAP7 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Asf1bQ9DAP7 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Asf1bQ9DAP7 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Asf1bQ9DAP7 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Asf1bQ9DAP7 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Asf1bQ9DAP7 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Asf1bQ9DAP7 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Asf1bQ9DAP7 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Asf1bQ9DAP7 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Asf1bQ9DAP7 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Asf1bQ9DAP7 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Asf1bQ9DAP7 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Asf1bQ9DAP7 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Asf1bQ9DAP7 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Asf1bQ9DAP7 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Asf1bQ9DAP7 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Asf1bQ9DAP7 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Asf1bQ9DAP7 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Asf1bQ9DAP7 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Asf1bQ9DAP7 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Asf1bQ9DAP7 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Asf1bQ9DAP7 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Asf1bQ9DAP7 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Asf1bQ9DAP7 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Asf1bQ9DAP7 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Asf1bQ9DAP7 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Asf1bQ9DAP7 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Asf1bQ9DAP7 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Asf1bQ9DAP7 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Asf1bQ9DAP7 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Asf1bQ9DAP7 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Asf1bQ9DAP7 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Asf1bQ9DAP7 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Asf1bQ9DAP7 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Asf1bQ9DAP7 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Asf1bQ9DAP7 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Asf1bQ9DAP7 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Asf1bQ9DAP7 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Asf1bQ9DAP7 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Asf1bQ9DAP7 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Asf1bQ9DAP7 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Asf1bQ9DAP7 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Asf1bQ9DAP7 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Asf1bQ9DAP7 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Asf1bQ9DAP7 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Asf1bQ9DAP7 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Asf1bQ9DAP7 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Asf1bQ9DAP7 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Asf1bQ9DAP7 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Asf1bQ9DAP7 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Asf1bQ9DAP7 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Asf1bQ9DAP7 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Asf1bQ9DAP7 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Asf1bQ9DAP7 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Asf1bQ9DAP7 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Asf1bQ9DAP7 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Asf1bQ9DAP7 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Asf1bQ9DAP7 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Asf1bQ9DAP7 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Asf1bQ9DAP7 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Asf1bQ9DAP7 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Asf1bQ9DAP7 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Asf1bQ9DAP7 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Asf1bQ9DAP7 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Asf1bQ9DAP7 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Asf1bQ9DAP7 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Asf1bQ9DAP7 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Asf1bQ9DAP7 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.5 ms