Protein–RNA interactions for Protein: Q9DAF1

1700012A03Rik, RIKEN cDNA 1700012A03 gene, mousemouse

Predictions only

Length 130 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
1700012A03RikQ9DAF1 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
1700012A03RikQ9DAF1 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
1700012A03RikQ9DAF1 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
1700012A03RikQ9DAF1 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
1700012A03RikQ9DAF1 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
1700012A03RikQ9DAF1 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC11.88□□□□□ -0.51
1700012A03RikQ9DAF1 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
1700012A03RikQ9DAF1 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC11.88□□□□□ -0.51
1700012A03RikQ9DAF1 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
1700012A03RikQ9DAF1 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
1700012A03RikQ9DAF1 Pank3-201ENSMUST00000018990 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
1700012A03RikQ9DAF1 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
1700012A03RikQ9DAF1 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
1700012A03RikQ9DAF1 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
1700012A03RikQ9DAF1 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
1700012A03RikQ9DAF1 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
1700012A03RikQ9DAF1 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
1700012A03RikQ9DAF1 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
1700012A03RikQ9DAF1 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
1700012A03RikQ9DAF1 Fam208a-201ENSMUST00000022450 7590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
1700012A03RikQ9DAF1 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
1700012A03RikQ9DAF1 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
1700012A03RikQ9DAF1 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
1700012A03RikQ9DAF1 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
1700012A03RikQ9DAF1 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC11.87□□□□□ -0.51
1700012A03RikQ9DAF1 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
1700012A03RikQ9DAF1 Shroom3-203ENSMUST00000113055 6765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
1700012A03RikQ9DAF1 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
1700012A03RikQ9DAF1 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
1700012A03RikQ9DAF1 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
1700012A03RikQ9DAF1 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
1700012A03RikQ9DAF1 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
1700012A03RikQ9DAF1 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
1700012A03RikQ9DAF1 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC11.87□□□□□ -0.51
1700012A03RikQ9DAF1 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
1700012A03RikQ9DAF1 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
1700012A03RikQ9DAF1 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
1700012A03RikQ9DAF1 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
1700012A03RikQ9DAF1 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
1700012A03RikQ9DAF1 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
1700012A03RikQ9DAF1 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
1700012A03RikQ9DAF1 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
1700012A03RikQ9DAF1 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
1700012A03RikQ9DAF1 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
1700012A03RikQ9DAF1 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
1700012A03RikQ9DAF1 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
1700012A03RikQ9DAF1 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC11.87□□□□□ -0.51
1700012A03RikQ9DAF1 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
1700012A03RikQ9DAF1 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
1700012A03RikQ9DAF1 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
1700012A03RikQ9DAF1 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
1700012A03RikQ9DAF1 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
1700012A03RikQ9DAF1 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
1700012A03RikQ9DAF1 Rsbn1-202ENSMUST00000068879 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
1700012A03RikQ9DAF1 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
1700012A03RikQ9DAF1 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
1700012A03RikQ9DAF1 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
1700012A03RikQ9DAF1 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
1700012A03RikQ9DAF1 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
1700012A03RikQ9DAF1 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
1700012A03RikQ9DAF1 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
1700012A03RikQ9DAF1 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
1700012A03RikQ9DAF1 Mlec-201ENSMUST00000112121 5955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
1700012A03RikQ9DAF1 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
1700012A03RikQ9DAF1 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
1700012A03RikQ9DAF1 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC11.86□□□□□ -0.51
1700012A03RikQ9DAF1 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
1700012A03RikQ9DAF1 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
1700012A03RikQ9DAF1 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
1700012A03RikQ9DAF1 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
1700012A03RikQ9DAF1 Tacc1-202ENSMUST00000084512 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
1700012A03RikQ9DAF1 Kmt5b-208ENSMUST00000113977 6002 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
1700012A03RikQ9DAF1 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
1700012A03RikQ9DAF1 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
1700012A03RikQ9DAF1 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
1700012A03RikQ9DAF1 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
1700012A03RikQ9DAF1 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
1700012A03RikQ9DAF1 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
1700012A03RikQ9DAF1 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
1700012A03RikQ9DAF1 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
1700012A03RikQ9DAF1 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
1700012A03RikQ9DAF1 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
1700012A03RikQ9DAF1 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
1700012A03RikQ9DAF1 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
1700012A03RikQ9DAF1 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
1700012A03RikQ9DAF1 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
1700012A03RikQ9DAF1 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
1700012A03RikQ9DAF1 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
1700012A03RikQ9DAF1 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
1700012A03RikQ9DAF1 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
1700012A03RikQ9DAF1 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
1700012A03RikQ9DAF1 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
1700012A03RikQ9DAF1 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
1700012A03RikQ9DAF1 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
1700012A03RikQ9DAF1 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC11.85□□□□□ -0.51
1700012A03RikQ9DAF1 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
1700012A03RikQ9DAF1 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
1700012A03RikQ9DAF1 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
1700012A03RikQ9DAF1 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
1700012A03RikQ9DAF1 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29 ms