Protein–RNA interactions for Protein: Q9D9M4

Pdzd9, PDZ domain-containing protein 9, mousemouse

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Length 266 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdzd9Q9D9M4 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Pdzd9Q9D9M4 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Pdzd9Q9D9M4 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Pdzd9Q9D9M4 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
Pdzd9Q9D9M4 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Pdzd9Q9D9M4 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Pdzd9Q9D9M4 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Pdzd9Q9D9M4 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Pdzd9Q9D9M4 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Pdzd9Q9D9M4 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Pdzd9Q9D9M4 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
Pdzd9Q9D9M4 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Pdzd9Q9D9M4 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
Pdzd9Q9D9M4 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Pdzd9Q9D9M4 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Pdzd9Q9D9M4 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Pdzd9Q9D9M4 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Pdzd9Q9D9M4 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Pdzd9Q9D9M4 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Pdzd9Q9D9M4 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Pdzd9Q9D9M4 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
Pdzd9Q9D9M4 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Pdzd9Q9D9M4 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Pdzd9Q9D9M4 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Pdzd9Q9D9M4 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Pdzd9Q9D9M4 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
Pdzd9Q9D9M4 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Pdzd9Q9D9M4 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Pdzd9Q9D9M4 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
Pdzd9Q9D9M4 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Pdzd9Q9D9M4 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Pdzd9Q9D9M4 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Pdzd9Q9D9M4 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Pdzd9Q9D9M4 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Pdzd9Q9D9M4 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Pdzd9Q9D9M4 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Pdzd9Q9D9M4 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Pdzd9Q9D9M4 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Pdzd9Q9D9M4 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Pdzd9Q9D9M4 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Pdzd9Q9D9M4 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Pdzd9Q9D9M4 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Pdzd9Q9D9M4 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Pdzd9Q9D9M4 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Pdzd9Q9D9M4 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Pdzd9Q9D9M4 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Pdzd9Q9D9M4 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Pdzd9Q9D9M4 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Pdzd9Q9D9M4 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Pdzd9Q9D9M4 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Pdzd9Q9D9M4 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Pdzd9Q9D9M4 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Pdzd9Q9D9M4 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Pdzd9Q9D9M4 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Pdzd9Q9D9M4 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Pdzd9Q9D9M4 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Pdzd9Q9D9M4 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Pdzd9Q9D9M4 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Pdzd9Q9D9M4 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Pdzd9Q9D9M4 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Pdzd9Q9D9M4 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Pdzd9Q9D9M4 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Pdzd9Q9D9M4 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Pdzd9Q9D9M4 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Pdzd9Q9D9M4 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Pdzd9Q9D9M4 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Pdzd9Q9D9M4 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Pdzd9Q9D9M4 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Pdzd9Q9D9M4 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Pdzd9Q9D9M4 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Pdzd9Q9D9M4 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Pdzd9Q9D9M4 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Pdzd9Q9D9M4 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Pdzd9Q9D9M4 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Pdzd9Q9D9M4 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Pdzd9Q9D9M4 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Pdzd9Q9D9M4 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Pdzd9Q9D9M4 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Pdzd9Q9D9M4 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Pdzd9Q9D9M4 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Pdzd9Q9D9M4 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Pdzd9Q9D9M4 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Pdzd9Q9D9M4 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Pdzd9Q9D9M4 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Pdzd9Q9D9M4 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Pdzd9Q9D9M4 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Pdzd9Q9D9M4 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Pdzd9Q9D9M4 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Pdzd9Q9D9M4 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Pdzd9Q9D9M4 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Pdzd9Q9D9M4 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Pdzd9Q9D9M4 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Pdzd9Q9D9M4 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Pdzd9Q9D9M4 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Pdzd9Q9D9M4 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Pdzd9Q9D9M4 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Pdzd9Q9D9M4 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Pdzd9Q9D9M4 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Pdzd9Q9D9M4 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Pdzd9Q9D9M4 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
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