Protein–RNA interactions for Protein: Q9D9J3

Actrt1, Actin-related protein T1, mousemouse

Predictions only

Length 376 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Actrt1Q9D9J3 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Actrt1Q9D9J3 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Actrt1Q9D9J3 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Actrt1Q9D9J3 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Actrt1Q9D9J3 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Actrt1Q9D9J3 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Actrt1Q9D9J3 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Actrt1Q9D9J3 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Actrt1Q9D9J3 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Actrt1Q9D9J3 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Actrt1Q9D9J3 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Actrt1Q9D9J3 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Actrt1Q9D9J3 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Actrt1Q9D9J3 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Actrt1Q9D9J3 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Actrt1Q9D9J3 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Actrt1Q9D9J3 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Actrt1Q9D9J3 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Actrt1Q9D9J3 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Actrt1Q9D9J3 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Actrt1Q9D9J3 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Actrt1Q9D9J3 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Actrt1Q9D9J3 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Actrt1Q9D9J3 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Actrt1Q9D9J3 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Actrt1Q9D9J3 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Actrt1Q9D9J3 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Actrt1Q9D9J3 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Actrt1Q9D9J3 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Actrt1Q9D9J3 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Actrt1Q9D9J3 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Actrt1Q9D9J3 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Actrt1Q9D9J3 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Actrt1Q9D9J3 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Actrt1Q9D9J3 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Actrt1Q9D9J3 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Actrt1Q9D9J3 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Actrt1Q9D9J3 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Actrt1Q9D9J3 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Actrt1Q9D9J3 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Actrt1Q9D9J3 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Actrt1Q9D9J3 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Actrt1Q9D9J3 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Actrt1Q9D9J3 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Actrt1Q9D9J3 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Actrt1Q9D9J3 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Actrt1Q9D9J3 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Actrt1Q9D9J3 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Actrt1Q9D9J3 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Actrt1Q9D9J3 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Actrt1Q9D9J3 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Actrt1Q9D9J3 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Actrt1Q9D9J3 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Actrt1Q9D9J3 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Actrt1Q9D9J3 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Actrt1Q9D9J3 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Actrt1Q9D9J3 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Actrt1Q9D9J3 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Actrt1Q9D9J3 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.34
Actrt1Q9D9J3 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Actrt1Q9D9J3 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Actrt1Q9D9J3 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Actrt1Q9D9J3 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Actrt1Q9D9J3 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Actrt1Q9D9J3 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Actrt1Q9D9J3 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Actrt1Q9D9J3 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Actrt1Q9D9J3 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Actrt1Q9D9J3 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Actrt1Q9D9J3 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Actrt1Q9D9J3 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Actrt1Q9D9J3 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Actrt1Q9D9J3 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Actrt1Q9D9J3 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Actrt1Q9D9J3 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Actrt1Q9D9J3 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Actrt1Q9D9J3 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Actrt1Q9D9J3 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Actrt1Q9D9J3 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Actrt1Q9D9J3 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Actrt1Q9D9J3 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Actrt1Q9D9J3 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Actrt1Q9D9J3 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Actrt1Q9D9J3 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Actrt1Q9D9J3 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Actrt1Q9D9J3 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Actrt1Q9D9J3 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Actrt1Q9D9J3 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Actrt1Q9D9J3 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Actrt1Q9D9J3 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Actrt1Q9D9J3 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Actrt1Q9D9J3 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Actrt1Q9D9J3 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Actrt1Q9D9J3 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Actrt1Q9D9J3 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Actrt1Q9D9J3 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Actrt1Q9D9J3 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Actrt1Q9D9J3 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Actrt1Q9D9J3 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Actrt1Q9D9J3 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.2 ms