Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8N6

Lin37, Protein lin-37 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 246 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lin37Q9D8N6 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Lin37Q9D8N6 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Lin37Q9D8N6 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Lin37Q9D8N6 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Lin37Q9D8N6 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Lin37Q9D8N6 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Lin37Q9D8N6 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Lin37Q9D8N6 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Lin37Q9D8N6 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Lin37Q9D8N6 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Lin37Q9D8N6 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Lin37Q9D8N6 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Lin37Q9D8N6 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Lin37Q9D8N6 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Lin37Q9D8N6 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Lin37Q9D8N6 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Lin37Q9D8N6 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Lin37Q9D8N6 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Lin37Q9D8N6 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Lin37Q9D8N6 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Lin37Q9D8N6 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Lin37Q9D8N6 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Lin37Q9D8N6 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Lin37Q9D8N6 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Lin37Q9D8N6 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Lin37Q9D8N6 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Lin37Q9D8N6 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Lin37Q9D8N6 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Lin37Q9D8N6 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Lin37Q9D8N6 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Lin37Q9D8N6 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Lin37Q9D8N6 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Lin37Q9D8N6 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Lin37Q9D8N6 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Lin37Q9D8N6 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Lin37Q9D8N6 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Lin37Q9D8N6 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Lin37Q9D8N6 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Lin37Q9D8N6 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Lin37Q9D8N6 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Lin37Q9D8N6 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Lin37Q9D8N6 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Lin37Q9D8N6 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Lin37Q9D8N6 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Lin37Q9D8N6 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Lin37Q9D8N6 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Lin37Q9D8N6 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Lin37Q9D8N6 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Lin37Q9D8N6 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Lin37Q9D8N6 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Lin37Q9D8N6 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Lin37Q9D8N6 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Lin37Q9D8N6 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Lin37Q9D8N6 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Lin37Q9D8N6 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Lin37Q9D8N6 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Lin37Q9D8N6 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Lin37Q9D8N6 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Lin37Q9D8N6 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Lin37Q9D8N6 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Lin37Q9D8N6 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Lin37Q9D8N6 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Lin37Q9D8N6 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Lin37Q9D8N6 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Lin37Q9D8N6 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Lin37Q9D8N6 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Lin37Q9D8N6 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Lin37Q9D8N6 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Lin37Q9D8N6 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Lin37Q9D8N6 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Lin37Q9D8N6 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Lin37Q9D8N6 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Lin37Q9D8N6 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Lin37Q9D8N6 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Lin37Q9D8N6 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Lin37Q9D8N6 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Lin37Q9D8N6 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Lin37Q9D8N6 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Lin37Q9D8N6 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Lin37Q9D8N6 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Lin37Q9D8N6 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Lin37Q9D8N6 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Lin37Q9D8N6 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Lin37Q9D8N6 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Lin37Q9D8N6 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Lin37Q9D8N6 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Lin37Q9D8N6 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Lin37Q9D8N6 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Lin37Q9D8N6 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Lin37Q9D8N6 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Lin37Q9D8N6 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Lin37Q9D8N6 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Lin37Q9D8N6 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Lin37Q9D8N6 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Lin37Q9D8N6 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Lin37Q9D8N6 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Lin37Q9D8N6 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Lin37Q9D8N6 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Lin37Q9D8N6 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Lin37Q9D8N6 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.5 ms