Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6J4

Necab3, N-terminal EF-hand calcium-binding protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 353 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Necab3Q9D6J4 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Necab3Q9D6J4 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Necab3Q9D6J4 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Necab3Q9D6J4 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Necab3Q9D6J4 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Necab3Q9D6J4 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Necab3Q9D6J4 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Necab3Q9D6J4 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Necab3Q9D6J4 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Necab3Q9D6J4 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Necab3Q9D6J4 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Necab3Q9D6J4 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Necab3Q9D6J4 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Necab3Q9D6J4 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Necab3Q9D6J4 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Necab3Q9D6J4 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Necab3Q9D6J4 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Necab3Q9D6J4 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Necab3Q9D6J4 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Necab3Q9D6J4 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Necab3Q9D6J4 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Necab3Q9D6J4 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Necab3Q9D6J4 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Necab3Q9D6J4 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Necab3Q9D6J4 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Necab3Q9D6J4 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Necab3Q9D6J4 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Necab3Q9D6J4 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Necab3Q9D6J4 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Necab3Q9D6J4 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Necab3Q9D6J4 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Necab3Q9D6J4 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Necab3Q9D6J4 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Necab3Q9D6J4 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Necab3Q9D6J4 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Necab3Q9D6J4 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Necab3Q9D6J4 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Necab3Q9D6J4 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Necab3Q9D6J4 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Necab3Q9D6J4 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Necab3Q9D6J4 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Necab3Q9D6J4 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Necab3Q9D6J4 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Necab3Q9D6J4 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Necab3Q9D6J4 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Necab3Q9D6J4 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Necab3Q9D6J4 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Necab3Q9D6J4 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Necab3Q9D6J4 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Necab3Q9D6J4 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Necab3Q9D6J4 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Necab3Q9D6J4 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Necab3Q9D6J4 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Necab3Q9D6J4 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Necab3Q9D6J4 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Necab3Q9D6J4 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Necab3Q9D6J4 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Necab3Q9D6J4 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Necab3Q9D6J4 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Necab3Q9D6J4 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Necab3Q9D6J4 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Necab3Q9D6J4 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Necab3Q9D6J4 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Necab3Q9D6J4 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Necab3Q9D6J4 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Necab3Q9D6J4 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Necab3Q9D6J4 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Necab3Q9D6J4 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Necab3Q9D6J4 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Necab3Q9D6J4 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Necab3Q9D6J4 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Necab3Q9D6J4 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Necab3Q9D6J4 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Necab3Q9D6J4 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Necab3Q9D6J4 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Necab3Q9D6J4 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Necab3Q9D6J4 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Necab3Q9D6J4 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Necab3Q9D6J4 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Necab3Q9D6J4 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Necab3Q9D6J4 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Necab3Q9D6J4 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Necab3Q9D6J4 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Necab3Q9D6J4 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Necab3Q9D6J4 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Necab3Q9D6J4 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Necab3Q9D6J4 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Necab3Q9D6J4 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Necab3Q9D6J4 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Necab3Q9D6J4 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Necab3Q9D6J4 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Necab3Q9D6J4 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Necab3Q9D6J4 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Necab3Q9D6J4 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Necab3Q9D6J4 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Necab3Q9D6J4 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Necab3Q9D6J4 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Necab3Q9D6J4 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Necab3Q9D6J4 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Necab3Q9D6J4 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 92.1 ms