Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4V3

Ccdc83, Coiled-coil domain-containing protein 83, mousemouse

Predictions only

Length 305 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc83Q9D4V3 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ccdc83Q9D4V3 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ccdc83Q9D4V3 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ccdc83Q9D4V3 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Ccdc83Q9D4V3 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ccdc83Q9D4V3 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ccdc83Q9D4V3 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ccdc83Q9D4V3 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ccdc83Q9D4V3 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ccdc83Q9D4V3 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ccdc83Q9D4V3 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ccdc83Q9D4V3 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ccdc83Q9D4V3 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ccdc83Q9D4V3 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ccdc83Q9D4V3 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ccdc83Q9D4V3 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ccdc83Q9D4V3 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ccdc83Q9D4V3 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ccdc83Q9D4V3 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ccdc83Q9D4V3 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Ccdc83Q9D4V3 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Ccdc83Q9D4V3 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ccdc83Q9D4V3 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ccdc83Q9D4V3 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ccdc83Q9D4V3 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ccdc83Q9D4V3 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ccdc83Q9D4V3 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Ccdc83Q9D4V3 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ccdc83Q9D4V3 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ccdc83Q9D4V3 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ccdc83Q9D4V3 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ccdc83Q9D4V3 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ccdc83Q9D4V3 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ccdc83Q9D4V3 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Ccdc83Q9D4V3 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ccdc83Q9D4V3 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ccdc83Q9D4V3 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ccdc83Q9D4V3 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ccdc83Q9D4V3 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ccdc83Q9D4V3 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ccdc83Q9D4V3 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ccdc83Q9D4V3 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ccdc83Q9D4V3 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ccdc83Q9D4V3 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ccdc83Q9D4V3 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ccdc83Q9D4V3 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ccdc83Q9D4V3 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ccdc83Q9D4V3 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ccdc83Q9D4V3 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ccdc83Q9D4V3 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ccdc83Q9D4V3 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ccdc83Q9D4V3 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ccdc83Q9D4V3 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ccdc83Q9D4V3 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ccdc83Q9D4V3 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ccdc83Q9D4V3 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ccdc83Q9D4V3 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ccdc83Q9D4V3 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ccdc83Q9D4V3 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ccdc83Q9D4V3 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ccdc83Q9D4V3 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ccdc83Q9D4V3 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ccdc83Q9D4V3 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ccdc83Q9D4V3 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ccdc83Q9D4V3 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ccdc83Q9D4V3 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ccdc83Q9D4V3 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ccdc83Q9D4V3 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ccdc83Q9D4V3 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ccdc83Q9D4V3 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ccdc83Q9D4V3 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ccdc83Q9D4V3 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ccdc83Q9D4V3 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ccdc83Q9D4V3 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ccdc83Q9D4V3 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ccdc83Q9D4V3 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ccdc83Q9D4V3 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ccdc83Q9D4V3 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ccdc83Q9D4V3 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ccdc83Q9D4V3 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ccdc83Q9D4V3 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ccdc83Q9D4V3 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ccdc83Q9D4V3 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ccdc83Q9D4V3 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ccdc83Q9D4V3 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ccdc83Q9D4V3 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ccdc83Q9D4V3 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ccdc83Q9D4V3 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ccdc83Q9D4V3 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ccdc83Q9D4V3 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ccdc83Q9D4V3 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ccdc83Q9D4V3 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ccdc83Q9D4V3 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ccdc83Q9D4V3 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ccdc83Q9D4V3 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ccdc83Q9D4V3 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ccdc83Q9D4V3 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ccdc83Q9D4V3 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Ccdc83Q9D4V3 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ccdc83Q9D4V3 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.3 ms