Protein–RNA interactions for Protein: Q9D3X4

4933428G20Rik, RIKEN cDNA 4933428G20 gene, mousemouse

Predictions only

Length 101 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4933428G20RikQ9D3X4 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
4933428G20RikQ9D3X4 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.25□□□□□ -1.41
4933428G20RikQ9D3X4 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
4933428G20RikQ9D3X4 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
4933428G20RikQ9D3X4 Myh3-203ENSMUST00000165221 5994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.25□□□□□ -1.41
4933428G20RikQ9D3X4 Myh13-202ENSMUST00000108684 6062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.25□□□□□ -1.41
4933428G20RikQ9D3X4 Lypd1-202ENSMUST00000159417 6464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
4933428G20RikQ9D3X4 Arhgap28-201ENSMUST00000024840 5322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
4933428G20RikQ9D3X4 Pcdha12-201ENSMUST00000047614 5335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
4933428G20RikQ9D3X4 Kdm3a-201ENSMUST00000065509 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
4933428G20RikQ9D3X4 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
4933428G20RikQ9D3X4 Ints1-210ENSMUST00000200393 7070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
4933428G20RikQ9D3X4 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
4933428G20RikQ9D3X4 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
4933428G20RikQ9D3X4 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
4933428G20RikQ9D3X4 Rnf40-202ENSMUST00000205694 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
4933428G20RikQ9D3X4 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
4933428G20RikQ9D3X4 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC6.25□□□□□ -1.41
4933428G20RikQ9D3X4 Elac1-201ENSMUST00000041138 4971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
4933428G20RikQ9D3X4 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.25□□□□□ -1.41
4933428G20RikQ9D3X4 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
4933428G20RikQ9D3X4 Cgnl1-202ENSMUST00000121322 6541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.25□□□□□ -1.41
4933428G20RikQ9D3X4 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
4933428G20RikQ9D3X4 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
4933428G20RikQ9D3X4 Reck-201ENSMUST00000030198 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
4933428G20RikQ9D3X4 Mtus2-203ENSMUST00000085558 7543 ntTSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
4933428G20RikQ9D3X4 Setx-201ENSMUST00000061578 10970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.24□□□□□ -1.41
4933428G20RikQ9D3X4 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
4933428G20RikQ9D3X4 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
4933428G20RikQ9D3X4 Ccdc88c-201ENSMUST00000068411 7542 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
4933428G20RikQ9D3X4 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
4933428G20RikQ9D3X4 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
4933428G20RikQ9D3X4 Mctp1-204ENSMUST00000125209 4715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
4933428G20RikQ9D3X4 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
4933428G20RikQ9D3X4 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
4933428G20RikQ9D3X4 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
4933428G20RikQ9D3X4 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
4933428G20RikQ9D3X4 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
4933428G20RikQ9D3X4 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
4933428G20RikQ9D3X4 Cfap69-201ENSMUST00000054865 4956 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
4933428G20RikQ9D3X4 Sertad2-203ENSMUST00000109586 5515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
4933428G20RikQ9D3X4 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC6.24□□□□□ -1.41
4933428G20RikQ9D3X4 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.24□□□□□ -1.41
4933428G20RikQ9D3X4 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
4933428G20RikQ9D3X4 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
4933428G20RikQ9D3X4 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
4933428G20RikQ9D3X4 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
4933428G20RikQ9D3X4 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC6.24□□□□□ -1.41
4933428G20RikQ9D3X4 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.24□□□□□ -1.41
4933428G20RikQ9D3X4 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
4933428G20RikQ9D3X4 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
4933428G20RikQ9D3X4 Arhgap35-202ENSMUST00000171937 6251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.24□□□□□ -1.41
4933428G20RikQ9D3X4 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
4933428G20RikQ9D3X4 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
4933428G20RikQ9D3X4 AC155298.2-201ENSMUST00000225485 6226 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
4933428G20RikQ9D3X4 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
4933428G20RikQ9D3X4 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
4933428G20RikQ9D3X4 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
4933428G20RikQ9D3X4 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
4933428G20RikQ9D3X4 Zc3h7b-201ENSMUST00000109554 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
4933428G20RikQ9D3X4 Camkk2-201ENSMUST00000111668 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
4933428G20RikQ9D3X4 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC6.23□□□□□ -1.41
4933428G20RikQ9D3X4 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.23□□□□□ -1.41
4933428G20RikQ9D3X4 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.23□□□□□ -1.41
4933428G20RikQ9D3X4 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.23□□□□□ -1.41
4933428G20RikQ9D3X4 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.23□□□□□ -1.41
4933428G20RikQ9D3X4 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.23□□□□□ -1.41
4933428G20RikQ9D3X4 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
4933428G20RikQ9D3X4 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.23□□□□□ -1.41
4933428G20RikQ9D3X4 Sugp2-214ENSMUST00000164403 4099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.23□□□□□ -1.41
4933428G20RikQ9D3X4 Scn5a-201ENSMUST00000065196 8287 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.23□□□□□ -1.41
4933428G20RikQ9D3X4 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC6.23□□□□□ -1.41
4933428G20RikQ9D3X4 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.23□□□□□ -1.41
4933428G20RikQ9D3X4 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.23□□□□□ -1.41
4933428G20RikQ9D3X4 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.23□□□□□ -1.41
4933428G20RikQ9D3X4 Nek1-201ENSMUST00000034065 5401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.23□□□□□ -1.41
4933428G20RikQ9D3X4 Camta2-203ENSMUST00000108544 4632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.23□□□□□ -1.41
4933428G20RikQ9D3X4 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC6.23□□□□□ -1.41
4933428G20RikQ9D3X4 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC6.23□□□□□ -1.41
4933428G20RikQ9D3X4 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC6.23□□□□□ -1.41
4933428G20RikQ9D3X4 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC6.23□□□□□ -1.41
4933428G20RikQ9D3X4 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
4933428G20RikQ9D3X4 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.23□□□□□ -1.41
4933428G20RikQ9D3X4 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.23□□□□□ -1.41
4933428G20RikQ9D3X4 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
4933428G20RikQ9D3X4 Satb2-202ENSMUST00000114415 5805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.23□□□□□ -1.41
4933428G20RikQ9D3X4 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
4933428G20RikQ9D3X4 Flnc-202ENSMUST00000101617 8939 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.23□□□□□ -1.41
4933428G20RikQ9D3X4 Pfas-201ENSMUST00000021282 6373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.23□□□□□ -1.41
4933428G20RikQ9D3X4 Tcf12-202ENSMUST00000183404 6299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.23□□□□□ -1.41
4933428G20RikQ9D3X4 Taf2-201ENSMUST00000041733 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.23□□□□□ -1.41
4933428G20RikQ9D3X4 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.23□□□□□ -1.41
4933428G20RikQ9D3X4 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.23□□□□□ -1.41
4933428G20RikQ9D3X4 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.23□□□□□ -1.41
4933428G20RikQ9D3X4 Gpr107-201ENSMUST00000056433 6134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.23□□□□□ -1.41
4933428G20RikQ9D3X4 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.23□□□□□ -1.41
4933428G20RikQ9D3X4 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC6.23□□□□□ -1.41
4933428G20RikQ9D3X4 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC6.23□□□□□ -1.41
4933428G20RikQ9D3X4 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.22□□□□□ -1.41
4933428G20RikQ9D3X4 Clip2-201ENSMUST00000036999 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.22□□□□□ -1.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31 ms