Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0Z3

Tmem53, Transmembrane protein 53, mousemouse

Predictions only

Length 276 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem53Q9D0Z3 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tmem53Q9D0Z3 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tmem53Q9D0Z3 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Tmem53Q9D0Z3 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tmem53Q9D0Z3 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tmem53Q9D0Z3 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tmem53Q9D0Z3 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tmem53Q9D0Z3 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tmem53Q9D0Z3 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tmem53Q9D0Z3 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tmem53Q9D0Z3 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tmem53Q9D0Z3 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tmem53Q9D0Z3 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tmem53Q9D0Z3 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tmem53Q9D0Z3 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tmem53Q9D0Z3 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tmem53Q9D0Z3 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tmem53Q9D0Z3 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tmem53Q9D0Z3 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tmem53Q9D0Z3 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tmem53Q9D0Z3 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tmem53Q9D0Z3 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tmem53Q9D0Z3 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tmem53Q9D0Z3 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tmem53Q9D0Z3 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tmem53Q9D0Z3 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tmem53Q9D0Z3 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tmem53Q9D0Z3 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tmem53Q9D0Z3 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tmem53Q9D0Z3 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tmem53Q9D0Z3 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Tmem53Q9D0Z3 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.34
Tmem53Q9D0Z3 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Tmem53Q9D0Z3 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tmem53Q9D0Z3 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tmem53Q9D0Z3 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tmem53Q9D0Z3 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Tmem53Q9D0Z3 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tmem53Q9D0Z3 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tmem53Q9D0Z3 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tmem53Q9D0Z3 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tmem53Q9D0Z3 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tmem53Q9D0Z3 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tmem53Q9D0Z3 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tmem53Q9D0Z3 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tmem53Q9D0Z3 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tmem53Q9D0Z3 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tmem53Q9D0Z3 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tmem53Q9D0Z3 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tmem53Q9D0Z3 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Tmem53Q9D0Z3 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tmem53Q9D0Z3 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tmem53Q9D0Z3 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tmem53Q9D0Z3 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Tmem53Q9D0Z3 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Tmem53Q9D0Z3 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Tmem53Q9D0Z3 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Tmem53Q9D0Z3 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Tmem53Q9D0Z3 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Tmem53Q9D0Z3 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Tmem53Q9D0Z3 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Tmem53Q9D0Z3 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Tmem53Q9D0Z3 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Tmem53Q9D0Z3 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Tmem53Q9D0Z3 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Tmem53Q9D0Z3 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Tmem53Q9D0Z3 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Tmem53Q9D0Z3 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Tmem53Q9D0Z3 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Tmem53Q9D0Z3 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Tmem53Q9D0Z3 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Tmem53Q9D0Z3 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Tmem53Q9D0Z3 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Tmem53Q9D0Z3 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Tmem53Q9D0Z3 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Tmem53Q9D0Z3 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Tmem53Q9D0Z3 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Tmem53Q9D0Z3 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Tmem53Q9D0Z3 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Tmem53Q9D0Z3 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Tmem53Q9D0Z3 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Tmem53Q9D0Z3 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Tmem53Q9D0Z3 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Tmem53Q9D0Z3 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Tmem53Q9D0Z3 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Tmem53Q9D0Z3 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Tmem53Q9D0Z3 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Tmem53Q9D0Z3 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Tmem53Q9D0Z3 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Tmem53Q9D0Z3 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Tmem53Q9D0Z3 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Tmem53Q9D0Z3 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Tmem53Q9D0Z3 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Tmem53Q9D0Z3 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Tmem53Q9D0Z3 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Tmem53Q9D0Z3 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Tmem53Q9D0Z3 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Tmem53Q9D0Z3 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Tmem53Q9D0Z3 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Tmem53Q9D0Z3 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 95.9 ms