Protein–RNA interactions for Protein: Q9CXE6

Xrcc3, DNA repair protein XRCC3, mousemouse

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Length 349 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Xrcc3Q9CXE6 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Xrcc3Q9CXE6 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Xrcc3Q9CXE6 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Xrcc3Q9CXE6 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Xrcc3Q9CXE6 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Xrcc3Q9CXE6 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Xrcc3Q9CXE6 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Xrcc3Q9CXE6 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Xrcc3Q9CXE6 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Xrcc3Q9CXE6 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Xrcc3Q9CXE6 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Xrcc3Q9CXE6 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Xrcc3Q9CXE6 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Xrcc3Q9CXE6 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Xrcc3Q9CXE6 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Xrcc3Q9CXE6 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Xrcc3Q9CXE6 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Xrcc3Q9CXE6 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Xrcc3Q9CXE6 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Xrcc3Q9CXE6 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Xrcc3Q9CXE6 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Xrcc3Q9CXE6 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Xrcc3Q9CXE6 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Xrcc3Q9CXE6 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Xrcc3Q9CXE6 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Xrcc3Q9CXE6 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Xrcc3Q9CXE6 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Xrcc3Q9CXE6 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Xrcc3Q9CXE6 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Xrcc3Q9CXE6 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Xrcc3Q9CXE6 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Xrcc3Q9CXE6 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Xrcc3Q9CXE6 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Xrcc3Q9CXE6 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Xrcc3Q9CXE6 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Xrcc3Q9CXE6 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Xrcc3Q9CXE6 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Xrcc3Q9CXE6 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Xrcc3Q9CXE6 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Xrcc3Q9CXE6 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Xrcc3Q9CXE6 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Xrcc3Q9CXE6 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
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Xrcc3Q9CXE6 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Xrcc3Q9CXE6 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Xrcc3Q9CXE6 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Xrcc3Q9CXE6 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Xrcc3Q9CXE6 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Xrcc3Q9CXE6 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Xrcc3Q9CXE6 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Xrcc3Q9CXE6 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Xrcc3Q9CXE6 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Xrcc3Q9CXE6 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Xrcc3Q9CXE6 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Xrcc3Q9CXE6 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Xrcc3Q9CXE6 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Xrcc3Q9CXE6 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Xrcc3Q9CXE6 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Xrcc3Q9CXE6 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Xrcc3Q9CXE6 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Xrcc3Q9CXE6 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Xrcc3Q9CXE6 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Xrcc3Q9CXE6 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Xrcc3Q9CXE6 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Xrcc3Q9CXE6 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Xrcc3Q9CXE6 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Xrcc3Q9CXE6 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Xrcc3Q9CXE6 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Xrcc3Q9CXE6 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Xrcc3Q9CXE6 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Xrcc3Q9CXE6 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Xrcc3Q9CXE6 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Xrcc3Q9CXE6 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Xrcc3Q9CXE6 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Xrcc3Q9CXE6 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Xrcc3Q9CXE6 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Xrcc3Q9CXE6 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Xrcc3Q9CXE6 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Xrcc3Q9CXE6 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Xrcc3Q9CXE6 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Xrcc3Q9CXE6 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Xrcc3Q9CXE6 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Xrcc3Q9CXE6 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Xrcc3Q9CXE6 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Xrcc3Q9CXE6 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Xrcc3Q9CXE6 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Xrcc3Q9CXE6 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Xrcc3Q9CXE6 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Xrcc3Q9CXE6 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Xrcc3Q9CXE6 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Xrcc3Q9CXE6 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Xrcc3Q9CXE6 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Xrcc3Q9CXE6 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Xrcc3Q9CXE6 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Xrcc3Q9CXE6 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Xrcc3Q9CXE6 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Xrcc3Q9CXE6 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Xrcc3Q9CXE6 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Xrcc3Q9CXE6 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Xrcc3Q9CXE6 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
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