Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWW7

Cxxc1, CXXC-type zinc finger protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 660 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cxxc1Q9CWW7 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cxxc1Q9CWW7 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cxxc1Q9CWW7 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cxxc1Q9CWW7 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cxxc1Q9CWW7 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cxxc1Q9CWW7 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cxxc1Q9CWW7 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cxxc1Q9CWW7 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cxxc1Q9CWW7 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cxxc1Q9CWW7 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cxxc1Q9CWW7 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cxxc1Q9CWW7 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Cxxc1Q9CWW7 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Cxxc1Q9CWW7 AC133598.3-202ENSMUST00000224219 531 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Cxxc1Q9CWW7 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cxxc1Q9CWW7 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cxxc1Q9CWW7 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cxxc1Q9CWW7 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cxxc1Q9CWW7 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cxxc1Q9CWW7 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cxxc1Q9CWW7 Gm25925-201ENSMUST00000158314 306 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Cxxc1Q9CWW7 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cxxc1Q9CWW7 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cxxc1Q9CWW7 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cxxc1Q9CWW7 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cxxc1Q9CWW7 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cxxc1Q9CWW7 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Cxxc1Q9CWW7 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Cxxc1Q9CWW7 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Cxxc1Q9CWW7 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Cxxc1Q9CWW7 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Cxxc1Q9CWW7 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC18.08■□□□□ 0.49
Cxxc1Q9CWW7 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Cxxc1Q9CWW7 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Cxxc1Q9CWW7 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Cxxc1Q9CWW7 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Cxxc1Q9CWW7 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Cxxc1Q9CWW7 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Cxxc1Q9CWW7 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Cxxc1Q9CWW7 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Cxxc1Q9CWW7 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Cxxc1Q9CWW7 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Cxxc1Q9CWW7 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Cxxc1Q9CWW7 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Cxxc1Q9CWW7 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Cxxc1Q9CWW7 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Cxxc1Q9CWW7 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Cxxc1Q9CWW7 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cxxc1Q9CWW7 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cxxc1Q9CWW7 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cxxc1Q9CWW7 9130024F11Rik-201ENSMUST00000135238 1300 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cxxc1Q9CWW7 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cxxc1Q9CWW7 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cxxc1Q9CWW7 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Cxxc1Q9CWW7 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cxxc1Q9CWW7 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cxxc1Q9CWW7 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cxxc1Q9CWW7 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cxxc1Q9CWW7 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cxxc1Q9CWW7 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cxxc1Q9CWW7 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cxxc1Q9CWW7 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cxxc1Q9CWW7 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cxxc1Q9CWW7 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cxxc1Q9CWW7 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cxxc1Q9CWW7 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cxxc1Q9CWW7 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cxxc1Q9CWW7 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cxxc1Q9CWW7 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cxxc1Q9CWW7 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cxxc1Q9CWW7 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cxxc1Q9CWW7 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cxxc1Q9CWW7 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cxxc1Q9CWW7 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cxxc1Q9CWW7 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cxxc1Q9CWW7 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cxxc1Q9CWW7 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cxxc1Q9CWW7 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cxxc1Q9CWW7 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cxxc1Q9CWW7 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cxxc1Q9CWW7 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cxxc1Q9CWW7 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cxxc1Q9CWW7 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cxxc1Q9CWW7 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cxxc1Q9CWW7 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cxxc1Q9CWW7 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Cxxc1Q9CWW7 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cxxc1Q9CWW7 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Cxxc1Q9CWW7 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cxxc1Q9CWW7 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cxxc1Q9CWW7 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cxxc1Q9CWW7 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cxxc1Q9CWW7 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cxxc1Q9CWW7 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cxxc1Q9CWW7 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cxxc1Q9CWW7 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cxxc1Q9CWW7 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cxxc1Q9CWW7 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cxxc1Q9CWW7 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cxxc1Q9CWW7 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.7 ms