Protein–RNA interactions for Protein: Q9CSV6

Sft2d3, Vesicle transport protein SFT2C, mousemouse

Predictions only

Length 209 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sft2d3Q9CSV6 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Sft2d3Q9CSV6 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Sft2d3Q9CSV6 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Sft2d3Q9CSV6 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Sft2d3Q9CSV6 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Sft2d3Q9CSV6 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Sft2d3Q9CSV6 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Sft2d3Q9CSV6 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Sft2d3Q9CSV6 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Sft2d3Q9CSV6 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Sft2d3Q9CSV6 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Sft2d3Q9CSV6 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Sft2d3Q9CSV6 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Sft2d3Q9CSV6 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Sft2d3Q9CSV6 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Sft2d3Q9CSV6 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Sft2d3Q9CSV6 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Sft2d3Q9CSV6 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Sft2d3Q9CSV6 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Sft2d3Q9CSV6 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Sft2d3Q9CSV6 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Sft2d3Q9CSV6 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Sft2d3Q9CSV6 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Sft2d3Q9CSV6 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Sft2d3Q9CSV6 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Sft2d3Q9CSV6 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Sft2d3Q9CSV6 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Sft2d3Q9CSV6 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Sft2d3Q9CSV6 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Sft2d3Q9CSV6 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Sft2d3Q9CSV6 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Sft2d3Q9CSV6 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Sft2d3Q9CSV6 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Sft2d3Q9CSV6 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Sft2d3Q9CSV6 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Sft2d3Q9CSV6 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Sft2d3Q9CSV6 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Sft2d3Q9CSV6 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Sft2d3Q9CSV6 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Sft2d3Q9CSV6 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Sft2d3Q9CSV6 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Sft2d3Q9CSV6 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Sft2d3Q9CSV6 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Sft2d3Q9CSV6 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Sft2d3Q9CSV6 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Sft2d3Q9CSV6 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Sft2d3Q9CSV6 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Sft2d3Q9CSV6 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Sft2d3Q9CSV6 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Sft2d3Q9CSV6 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Sft2d3Q9CSV6 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Sft2d3Q9CSV6 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Sft2d3Q9CSV6 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Sft2d3Q9CSV6 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Sft2d3Q9CSV6 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Sft2d3Q9CSV6 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Sft2d3Q9CSV6 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Sft2d3Q9CSV6 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Sft2d3Q9CSV6 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Sft2d3Q9CSV6 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Sft2d3Q9CSV6 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Sft2d3Q9CSV6 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Sft2d3Q9CSV6 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Sft2d3Q9CSV6 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Sft2d3Q9CSV6 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Sft2d3Q9CSV6 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Sft2d3Q9CSV6 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Sft2d3Q9CSV6 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Sft2d3Q9CSV6 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Sft2d3Q9CSV6 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Sft2d3Q9CSV6 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Sft2d3Q9CSV6 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Sft2d3Q9CSV6 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Sft2d3Q9CSV6 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Sft2d3Q9CSV6 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Sft2d3Q9CSV6 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Sft2d3Q9CSV6 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Sft2d3Q9CSV6 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Sft2d3Q9CSV6 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Sft2d3Q9CSV6 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Sft2d3Q9CSV6 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Sft2d3Q9CSV6 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Sft2d3Q9CSV6 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Sft2d3Q9CSV6 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Sft2d3Q9CSV6 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Sft2d3Q9CSV6 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Sft2d3Q9CSV6 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Sft2d3Q9CSV6 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Sft2d3Q9CSV6 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Sft2d3Q9CSV6 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Sft2d3Q9CSV6 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Sft2d3Q9CSV6 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Sft2d3Q9CSV6 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Sft2d3Q9CSV6 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Sft2d3Q9CSV6 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Sft2d3Q9CSV6 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Sft2d3Q9CSV6 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Sft2d3Q9CSV6 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Sft2d3Q9CSV6 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Sft2d3Q9CSV6 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.3 ms