Protein–RNA interactions for Protein: Q9CSN1

Snw1, SNW domain-containing protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 536 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snw1Q9CSN1 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Snw1Q9CSN1 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Snw1Q9CSN1 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Snw1Q9CSN1 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Snw1Q9CSN1 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Snw1Q9CSN1 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Snw1Q9CSN1 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Snw1Q9CSN1 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Snw1Q9CSN1 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Snw1Q9CSN1 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Snw1Q9CSN1 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
Snw1Q9CSN1 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
Snw1Q9CSN1 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
Snw1Q9CSN1 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Snw1Q9CSN1 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Snw1Q9CSN1 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Snw1Q9CSN1 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Snw1Q9CSN1 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Snw1Q9CSN1 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Snw1Q9CSN1 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Snw1Q9CSN1 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Snw1Q9CSN1 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Snw1Q9CSN1 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
Snw1Q9CSN1 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Snw1Q9CSN1 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Snw1Q9CSN1 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
Snw1Q9CSN1 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Snw1Q9CSN1 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
Snw1Q9CSN1 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Snw1Q9CSN1 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Snw1Q9CSN1 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Snw1Q9CSN1 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Snw1Q9CSN1 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Snw1Q9CSN1 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Snw1Q9CSN1 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Snw1Q9CSN1 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Snw1Q9CSN1 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Snw1Q9CSN1 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Snw1Q9CSN1 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Snw1Q9CSN1 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
Snw1Q9CSN1 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Snw1Q9CSN1 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Snw1Q9CSN1 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Snw1Q9CSN1 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Snw1Q9CSN1 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Snw1Q9CSN1 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
Snw1Q9CSN1 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Snw1Q9CSN1 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Snw1Q9CSN1 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Snw1Q9CSN1 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Snw1Q9CSN1 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Snw1Q9CSN1 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Snw1Q9CSN1 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
Snw1Q9CSN1 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Snw1Q9CSN1 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Snw1Q9CSN1 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Snw1Q9CSN1 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Snw1Q9CSN1 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Snw1Q9CSN1 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Snw1Q9CSN1 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Snw1Q9CSN1 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Snw1Q9CSN1 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Snw1Q9CSN1 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Snw1Q9CSN1 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Snw1Q9CSN1 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Snw1Q9CSN1 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Snw1Q9CSN1 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Snw1Q9CSN1 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Snw1Q9CSN1 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Snw1Q9CSN1 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Snw1Q9CSN1 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Snw1Q9CSN1 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Snw1Q9CSN1 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Snw1Q9CSN1 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Snw1Q9CSN1 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Snw1Q9CSN1 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Snw1Q9CSN1 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Snw1Q9CSN1 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Snw1Q9CSN1 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Snw1Q9CSN1 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
Snw1Q9CSN1 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Snw1Q9CSN1 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Snw1Q9CSN1 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Snw1Q9CSN1 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Snw1Q9CSN1 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Snw1Q9CSN1 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Snw1Q9CSN1 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Snw1Q9CSN1 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
Snw1Q9CSN1 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Snw1Q9CSN1 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
Snw1Q9CSN1 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
Snw1Q9CSN1 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Snw1Q9CSN1 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Snw1Q9CSN1 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Snw1Q9CSN1 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Snw1Q9CSN1 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Snw1Q9CSN1 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Snw1Q9CSN1 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Snw1Q9CSN1 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Snw1Q9CSN1 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.8 ms