Protein–RNA interactions for Protein: Q9CR05

4931417E11Rik, RIKEN cDNA 4931417E11, mousemouse

Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4931417E11RikQ9CR05 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
4931417E11RikQ9CR05 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
4931417E11RikQ9CR05 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
4931417E11RikQ9CR05 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
4931417E11RikQ9CR05 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
4931417E11RikQ9CR05 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
4931417E11RikQ9CR05 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
4931417E11RikQ9CR05 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
4931417E11RikQ9CR05 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
4931417E11RikQ9CR05 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
4931417E11RikQ9CR05 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
4931417E11RikQ9CR05 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
4931417E11RikQ9CR05 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
4931417E11RikQ9CR05 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
4931417E11RikQ9CR05 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
4931417E11RikQ9CR05 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
4931417E11RikQ9CR05 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
4931417E11RikQ9CR05 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
4931417E11RikQ9CR05 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
4931417E11RikQ9CR05 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
4931417E11RikQ9CR05 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
4931417E11RikQ9CR05 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
4931417E11RikQ9CR05 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
4931417E11RikQ9CR05 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
4931417E11RikQ9CR05 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
4931417E11RikQ9CR05 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
4931417E11RikQ9CR05 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
4931417E11RikQ9CR05 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
4931417E11RikQ9CR05 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
4931417E11RikQ9CR05 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
4931417E11RikQ9CR05 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
4931417E11RikQ9CR05 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
4931417E11RikQ9CR05 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
4931417E11RikQ9CR05 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
4931417E11RikQ9CR05 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
4931417E11RikQ9CR05 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
4931417E11RikQ9CR05 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
4931417E11RikQ9CR05 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
4931417E11RikQ9CR05 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
4931417E11RikQ9CR05 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
4931417E11RikQ9CR05 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
4931417E11RikQ9CR05 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
4931417E11RikQ9CR05 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
4931417E11RikQ9CR05 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
4931417E11RikQ9CR05 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
4931417E11RikQ9CR05 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
4931417E11RikQ9CR05 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
4931417E11RikQ9CR05 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
4931417E11RikQ9CR05 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
4931417E11RikQ9CR05 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
4931417E11RikQ9CR05 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
4931417E11RikQ9CR05 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
4931417E11RikQ9CR05 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
4931417E11RikQ9CR05 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
4931417E11RikQ9CR05 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
4931417E11RikQ9CR05 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
4931417E11RikQ9CR05 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
4931417E11RikQ9CR05 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
4931417E11RikQ9CR05 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
4931417E11RikQ9CR05 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
4931417E11RikQ9CR05 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
4931417E11RikQ9CR05 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
4931417E11RikQ9CR05 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
4931417E11RikQ9CR05 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
4931417E11RikQ9CR05 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
4931417E11RikQ9CR05 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
4931417E11RikQ9CR05 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
4931417E11RikQ9CR05 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
4931417E11RikQ9CR05 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
4931417E11RikQ9CR05 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
4931417E11RikQ9CR05 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
4931417E11RikQ9CR05 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
4931417E11RikQ9CR05 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
4931417E11RikQ9CR05 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
4931417E11RikQ9CR05 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
4931417E11RikQ9CR05 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
4931417E11RikQ9CR05 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
4931417E11RikQ9CR05 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
4931417E11RikQ9CR05 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
4931417E11RikQ9CR05 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
4931417E11RikQ9CR05 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
4931417E11RikQ9CR05 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
4931417E11RikQ9CR05 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
4931417E11RikQ9CR05 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
4931417E11RikQ9CR05 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
4931417E11RikQ9CR05 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
4931417E11RikQ9CR05 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
4931417E11RikQ9CR05 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
4931417E11RikQ9CR05 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC16.66■□□□□ 0.26
4931417E11RikQ9CR05 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC16.66■□□□□ 0.26
4931417E11RikQ9CR05 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
4931417E11RikQ9CR05 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
4931417E11RikQ9CR05 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
4931417E11RikQ9CR05 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
4931417E11RikQ9CR05 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
4931417E11RikQ9CR05 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
4931417E11RikQ9CR05 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
4931417E11RikQ9CR05 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
4931417E11RikQ9CR05 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC16.65■□□□□ 0.26
4931417E11RikQ9CR05 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.9 ms