Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQH0

Pdzk1ip1, PDZK1-interacting protein 1, mousemouse

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Length 114 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pdzk1ip1Q9CQH0 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pdzk1ip1Q9CQH0 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pdzk1ip1Q9CQH0 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pdzk1ip1Q9CQH0 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pdzk1ip1Q9CQH0 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pdzk1ip1Q9CQH0 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pdzk1ip1Q9CQH0 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pdzk1ip1Q9CQH0 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pdzk1ip1Q9CQH0 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pdzk1ip1Q9CQH0 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Pdzk1ip1Q9CQH0 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Pdzk1ip1Q9CQH0 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pdzk1ip1Q9CQH0 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pdzk1ip1Q9CQH0 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pdzk1ip1Q9CQH0 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pdzk1ip1Q9CQH0 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pdzk1ip1Q9CQH0 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pdzk1ip1Q9CQH0 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Pdzk1ip1Q9CQH0 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pdzk1ip1Q9CQH0 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pdzk1ip1Q9CQH0 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pdzk1ip1Q9CQH0 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pdzk1ip1Q9CQH0 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pdzk1ip1Q9CQH0 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Pdzk1ip1Q9CQH0 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Pdzk1ip1Q9CQH0 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Pdzk1ip1Q9CQH0 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Pdzk1ip1Q9CQH0 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Pdzk1ip1Q9CQH0 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pdzk1ip1Q9CQH0 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pdzk1ip1Q9CQH0 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pdzk1ip1Q9CQH0 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pdzk1ip1Q9CQH0 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pdzk1ip1Q9CQH0 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pdzk1ip1Q9CQH0 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pdzk1ip1Q9CQH0 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pdzk1ip1Q9CQH0 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pdzk1ip1Q9CQH0 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pdzk1ip1Q9CQH0 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pdzk1ip1Q9CQH0 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pdzk1ip1Q9CQH0 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pdzk1ip1Q9CQH0 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pdzk1ip1Q9CQH0 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pdzk1ip1Q9CQH0 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pdzk1ip1Q9CQH0 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pdzk1ip1Q9CQH0 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
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Pdzk1ip1Q9CQH0 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pdzk1ip1Q9CQH0 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pdzk1ip1Q9CQH0 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pdzk1ip1Q9CQH0 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pdzk1ip1Q9CQH0 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pdzk1ip1Q9CQH0 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
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Pdzk1ip1Q9CQH0 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pdzk1ip1Q9CQH0 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pdzk1ip1Q9CQH0 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pdzk1ip1Q9CQH0 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pdzk1ip1Q9CQH0 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
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Pdzk1ip1Q9CQH0 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pdzk1ip1Q9CQH0 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pdzk1ip1Q9CQH0 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pdzk1ip1Q9CQH0 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pdzk1ip1Q9CQH0 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pdzk1ip1Q9CQH0 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pdzk1ip1Q9CQH0 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pdzk1ip1Q9CQH0 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pdzk1ip1Q9CQH0 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pdzk1ip1Q9CQH0 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pdzk1ip1Q9CQH0 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pdzk1ip1Q9CQH0 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pdzk1ip1Q9CQH0 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pdzk1ip1Q9CQH0 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pdzk1ip1Q9CQH0 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pdzk1ip1Q9CQH0 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pdzk1ip1Q9CQH0 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pdzk1ip1Q9CQH0 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pdzk1ip1Q9CQH0 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pdzk1ip1Q9CQH0 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pdzk1ip1Q9CQH0 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pdzk1ip1Q9CQH0 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pdzk1ip1Q9CQH0 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pdzk1ip1Q9CQH0 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pdzk1ip1Q9CQH0 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Pdzk1ip1Q9CQH0 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pdzk1ip1Q9CQH0 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pdzk1ip1Q9CQH0 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pdzk1ip1Q9CQH0 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pdzk1ip1Q9CQH0 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pdzk1ip1Q9CQH0 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pdzk1ip1Q9CQH0 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
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