Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQE8

RTRAF, RNA transcription, translation and transport factor protein, mousemouse

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Length 244 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTRAFQ9CQE8 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
RTRAFQ9CQE8 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
RTRAFQ9CQE8 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
RTRAFQ9CQE8 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
RTRAFQ9CQE8 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
RTRAFQ9CQE8 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
RTRAFQ9CQE8 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
RTRAFQ9CQE8 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
RTRAFQ9CQE8 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
RTRAFQ9CQE8 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
RTRAFQ9CQE8 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
RTRAFQ9CQE8 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
RTRAFQ9CQE8 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
RTRAFQ9CQE8 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
RTRAFQ9CQE8 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
RTRAFQ9CQE8 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
RTRAFQ9CQE8 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
RTRAFQ9CQE8 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
RTRAFQ9CQE8 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
RTRAFQ9CQE8 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
RTRAFQ9CQE8 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
RTRAFQ9CQE8 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
RTRAFQ9CQE8 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
RTRAFQ9CQE8 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
RTRAFQ9CQE8 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
RTRAFQ9CQE8 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
RTRAFQ9CQE8 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
RTRAFQ9CQE8 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
RTRAFQ9CQE8 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
RTRAFQ9CQE8 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
RTRAFQ9CQE8 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
RTRAFQ9CQE8 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
RTRAFQ9CQE8 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
RTRAFQ9CQE8 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
RTRAFQ9CQE8 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
RTRAFQ9CQE8 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
RTRAFQ9CQE8 Tchh-201ENSMUST00000064257 5823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
RTRAFQ9CQE8 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
RTRAFQ9CQE8 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
RTRAFQ9CQE8 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
RTRAFQ9CQE8 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
RTRAFQ9CQE8 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
RTRAFQ9CQE8 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
RTRAFQ9CQE8 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
RTRAFQ9CQE8 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
RTRAFQ9CQE8 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
RTRAFQ9CQE8 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
RTRAFQ9CQE8 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
RTRAFQ9CQE8 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
RTRAFQ9CQE8 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
RTRAFQ9CQE8 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
RTRAFQ9CQE8 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
RTRAFQ9CQE8 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
RTRAFQ9CQE8 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
RTRAFQ9CQE8 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
RTRAFQ9CQE8 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
RTRAFQ9CQE8 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
RTRAFQ9CQE8 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
RTRAFQ9CQE8 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
RTRAFQ9CQE8 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
RTRAFQ9CQE8 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
RTRAFQ9CQE8 Btaf1-201ENSMUST00000099494 7204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
RTRAFQ9CQE8 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
RTRAFQ9CQE8 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
RTRAFQ9CQE8 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
RTRAFQ9CQE8 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
RTRAFQ9CQE8 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
RTRAFQ9CQE8 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
RTRAFQ9CQE8 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
RTRAFQ9CQE8 Cacna1g-201ENSMUST00000021234 8139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
RTRAFQ9CQE8 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
RTRAFQ9CQE8 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
RTRAFQ9CQE8 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
RTRAFQ9CQE8 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
RTRAFQ9CQE8 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
RTRAFQ9CQE8 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
RTRAFQ9CQE8 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
RTRAFQ9CQE8 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
RTRAFQ9CQE8 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
RTRAFQ9CQE8 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
RTRAFQ9CQE8 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
RTRAFQ9CQE8 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
RTRAFQ9CQE8 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
RTRAFQ9CQE8 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
RTRAFQ9CQE8 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
RTRAFQ9CQE8 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
RTRAFQ9CQE8 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
RTRAFQ9CQE8 Ptprt-202ENSMUST00000109442 7719 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
RTRAFQ9CQE8 Shank3-201ENSMUST00000039074 7131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
RTRAFQ9CQE8 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
RTRAFQ9CQE8 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
RTRAFQ9CQE8 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
RTRAFQ9CQE8 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
RTRAFQ9CQE8 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
RTRAFQ9CQE8 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
RTRAFQ9CQE8 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
RTRAFQ9CQE8 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
RTRAFQ9CQE8 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
RTRAFQ9CQE8 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
RTRAFQ9CQE8 Cdh11-201ENSMUST00000075190 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
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