Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ02

Commd4, COMM domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 199 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Commd4Q9CQ02 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Commd4Q9CQ02 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Commd4Q9CQ02 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Commd4Q9CQ02 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Commd4Q9CQ02 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Commd4Q9CQ02 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Commd4Q9CQ02 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Commd4Q9CQ02 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Commd4Q9CQ02 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Commd4Q9CQ02 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Commd4Q9CQ02 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Commd4Q9CQ02 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Commd4Q9CQ02 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Commd4Q9CQ02 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Commd4Q9CQ02 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Commd4Q9CQ02 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Commd4Q9CQ02 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Commd4Q9CQ02 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Commd4Q9CQ02 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Commd4Q9CQ02 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Commd4Q9CQ02 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Commd4Q9CQ02 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Commd4Q9CQ02 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Commd4Q9CQ02 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Commd4Q9CQ02 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Commd4Q9CQ02 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Commd4Q9CQ02 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Commd4Q9CQ02 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Commd4Q9CQ02 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Commd4Q9CQ02 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Commd4Q9CQ02 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Commd4Q9CQ02 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Commd4Q9CQ02 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Commd4Q9CQ02 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Commd4Q9CQ02 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Commd4Q9CQ02 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Commd4Q9CQ02 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Commd4Q9CQ02 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Commd4Q9CQ02 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Commd4Q9CQ02 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Commd4Q9CQ02 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Commd4Q9CQ02 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Commd4Q9CQ02 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Commd4Q9CQ02 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Commd4Q9CQ02 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Commd4Q9CQ02 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Commd4Q9CQ02 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Commd4Q9CQ02 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Commd4Q9CQ02 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Commd4Q9CQ02 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Commd4Q9CQ02 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Commd4Q9CQ02 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Commd4Q9CQ02 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Commd4Q9CQ02 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Commd4Q9CQ02 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Commd4Q9CQ02 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Commd4Q9CQ02 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Commd4Q9CQ02 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Commd4Q9CQ02 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Commd4Q9CQ02 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Commd4Q9CQ02 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Commd4Q9CQ02 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Commd4Q9CQ02 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Commd4Q9CQ02 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Commd4Q9CQ02 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Commd4Q9CQ02 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Commd4Q9CQ02 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Commd4Q9CQ02 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Commd4Q9CQ02 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Commd4Q9CQ02 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Commd4Q9CQ02 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Commd4Q9CQ02 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Commd4Q9CQ02 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Commd4Q9CQ02 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Commd4Q9CQ02 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Commd4Q9CQ02 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Commd4Q9CQ02 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Commd4Q9CQ02 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Commd4Q9CQ02 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Commd4Q9CQ02 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Commd4Q9CQ02 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Commd4Q9CQ02 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Commd4Q9CQ02 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Commd4Q9CQ02 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Commd4Q9CQ02 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Commd4Q9CQ02 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Commd4Q9CQ02 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Commd4Q9CQ02 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Commd4Q9CQ02 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Commd4Q9CQ02 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Commd4Q9CQ02 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Commd4Q9CQ02 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Commd4Q9CQ02 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Commd4Q9CQ02 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Commd4Q9CQ02 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Commd4Q9CQ02 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Commd4Q9CQ02 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Commd4Q9CQ02 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Commd4Q9CQ02 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Commd4Q9CQ02 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.1 ms