Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXW4

MAP1LC3C, Microtubule-associated proteins 1A/1B light chain 3C, humanhuman

Predictions only

Length 147 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MAP1LC3CQ9BXW4 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
MAP1LC3CQ9BXW4 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
MAP1LC3CQ9BXW4 PCDHA8-202ENST00000531613 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
MAP1LC3CQ9BXW4 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
MAP1LC3CQ9BXW4 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
MAP1LC3CQ9BXW4 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
MAP1LC3CQ9BXW4 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
MAP1LC3CQ9BXW4 EIF4G3-205ENST00000400422 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
MAP1LC3CQ9BXW4 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
MAP1LC3CQ9BXW4 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
MAP1LC3CQ9BXW4 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
MAP1LC3CQ9BXW4 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
MAP1LC3CQ9BXW4 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
MAP1LC3CQ9BXW4 AL355987.4-201ENST00000415992 4244 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
MAP1LC3CQ9BXW4 FGD5-201ENST00000285046 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
MAP1LC3CQ9BXW4 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
MAP1LC3CQ9BXW4 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
MAP1LC3CQ9BXW4 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
MAP1LC3CQ9BXW4 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
MAP1LC3CQ9BXW4 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
MAP1LC3CQ9BXW4 ZNF280D-205ENST00000559000 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
MAP1LC3CQ9BXW4 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
MAP1LC3CQ9BXW4 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC14.99□□□□□ -0.01
MAP1LC3CQ9BXW4 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
MAP1LC3CQ9BXW4 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
MAP1LC3CQ9BXW4 ZBTB7C-201ENST00000535628 4818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
MAP1LC3CQ9BXW4 ZNF697-201ENST00000421812 5041 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
MAP1LC3CQ9BXW4 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
MAP1LC3CQ9BXW4 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
MAP1LC3CQ9BXW4 EVPL-202ENST00000586740 6223 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
MAP1LC3CQ9BXW4 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.98□□□□□ -0.01
MAP1LC3CQ9BXW4 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
MAP1LC3CQ9BXW4 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
MAP1LC3CQ9BXW4 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
MAP1LC3CQ9BXW4 COBLL1-201ENST00000342193 4898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
MAP1LC3CQ9BXW4 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
MAP1LC3CQ9BXW4 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC14.98□□□□□ -0.01
MAP1LC3CQ9BXW4 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
MAP1LC3CQ9BXW4 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
MAP1LC3CQ9BXW4 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
MAP1LC3CQ9BXW4 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
MAP1LC3CQ9BXW4 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
MAP1LC3CQ9BXW4 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC14.98□□□□□ -0.01
MAP1LC3CQ9BXW4 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
MAP1LC3CQ9BXW4 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
MAP1LC3CQ9BXW4 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
MAP1LC3CQ9BXW4 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
MAP1LC3CQ9BXW4 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
MAP1LC3CQ9BXW4 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
MAP1LC3CQ9BXW4 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
MAP1LC3CQ9BXW4 ITSN2-201ENST00000355123 6300 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
MAP1LC3CQ9BXW4 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
MAP1LC3CQ9BXW4 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
MAP1LC3CQ9BXW4 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
MAP1LC3CQ9BXW4 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
MAP1LC3CQ9BXW4 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
MAP1LC3CQ9BXW4 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
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MAP1LC3CQ9BXW4 SLC8A3-202ENST00000356921 5250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
MAP1LC3CQ9BXW4 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
MAP1LC3CQ9BXW4 ADGRB2-201ENST00000373655 5400 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
MAP1LC3CQ9BXW4 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
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MAP1LC3CQ9BXW4 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
MAP1LC3CQ9BXW4 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
MAP1LC3CQ9BXW4 RAB22A-201ENST00000244040 8670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
MAP1LC3CQ9BXW4 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
MAP1LC3CQ9BXW4 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
MAP1LC3CQ9BXW4 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
MAP1LC3CQ9BXW4 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
MAP1LC3CQ9BXW4 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
MAP1LC3CQ9BXW4 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
MAP1LC3CQ9BXW4 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
MAP1LC3CQ9BXW4 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
MAP1LC3CQ9BXW4 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
MAP1LC3CQ9BXW4 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
MAP1LC3CQ9BXW4 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC14.97□□□□□ -0.01
MAP1LC3CQ9BXW4 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
MAP1LC3CQ9BXW4 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
MAP1LC3CQ9BXW4 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
MAP1LC3CQ9BXW4 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
MAP1LC3CQ9BXW4 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
MAP1LC3CQ9BXW4 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
MAP1LC3CQ9BXW4 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
MAP1LC3CQ9BXW4 MGLL-204ENST00000434178 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
MAP1LC3CQ9BXW4 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
MAP1LC3CQ9BXW4 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
MAP1LC3CQ9BXW4 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
MAP1LC3CQ9BXW4 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
MAP1LC3CQ9BXW4 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
MAP1LC3CQ9BXW4 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
MAP1LC3CQ9BXW4 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
MAP1LC3CQ9BXW4 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.02
MAP1LC3CQ9BXW4 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
MAP1LC3CQ9BXW4 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.02
MAP1LC3CQ9BXW4 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
MAP1LC3CQ9BXW4 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC14.96□□□□□ -0.02
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