Protein–RNA interactions for Protein: Q99PQ1

Trim12a, Tripartite motif-containing protein 12A, mousemouse

Predictions only

Length 284 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim12aQ99PQ1 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Trim12aQ99PQ1 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Trim12aQ99PQ1 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
Trim12aQ99PQ1 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Trim12aQ99PQ1 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Trim12aQ99PQ1 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Trim12aQ99PQ1 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Trim12aQ99PQ1 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Trim12aQ99PQ1 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Trim12aQ99PQ1 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Trim12aQ99PQ1 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Trim12aQ99PQ1 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Trim12aQ99PQ1 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Trim12aQ99PQ1 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Trim12aQ99PQ1 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Trim12aQ99PQ1 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Trim12aQ99PQ1 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Trim12aQ99PQ1 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Trim12aQ99PQ1 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Trim12aQ99PQ1 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Trim12aQ99PQ1 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Trim12aQ99PQ1 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Trim12aQ99PQ1 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Trim12aQ99PQ1 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Trim12aQ99PQ1 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Trim12aQ99PQ1 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Trim12aQ99PQ1 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Trim12aQ99PQ1 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Trim12aQ99PQ1 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Trim12aQ99PQ1 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Trim12aQ99PQ1 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Trim12aQ99PQ1 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Trim12aQ99PQ1 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Trim12aQ99PQ1 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Trim12aQ99PQ1 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Trim12aQ99PQ1 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Trim12aQ99PQ1 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Trim12aQ99PQ1 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Trim12aQ99PQ1 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Trim12aQ99PQ1 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Trim12aQ99PQ1 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Trim12aQ99PQ1 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Trim12aQ99PQ1 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Trim12aQ99PQ1 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Trim12aQ99PQ1 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Trim12aQ99PQ1 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Trim12aQ99PQ1 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Trim12aQ99PQ1 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Trim12aQ99PQ1 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Trim12aQ99PQ1 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Trim12aQ99PQ1 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Trim12aQ99PQ1 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Trim12aQ99PQ1 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Trim12aQ99PQ1 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Trim12aQ99PQ1 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Trim12aQ99PQ1 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Trim12aQ99PQ1 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Trim12aQ99PQ1 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Trim12aQ99PQ1 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Trim12aQ99PQ1 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Trim12aQ99PQ1 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Trim12aQ99PQ1 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Trim12aQ99PQ1 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Trim12aQ99PQ1 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Trim12aQ99PQ1 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Trim12aQ99PQ1 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Trim12aQ99PQ1 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Trim12aQ99PQ1 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Trim12aQ99PQ1 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Trim12aQ99PQ1 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Trim12aQ99PQ1 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Trim12aQ99PQ1 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Trim12aQ99PQ1 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Trim12aQ99PQ1 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Trim12aQ99PQ1 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Trim12aQ99PQ1 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Trim12aQ99PQ1 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Trim12aQ99PQ1 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Trim12aQ99PQ1 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Trim12aQ99PQ1 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Trim12aQ99PQ1 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Trim12aQ99PQ1 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Trim12aQ99PQ1 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Trim12aQ99PQ1 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Trim12aQ99PQ1 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Trim12aQ99PQ1 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Trim12aQ99PQ1 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Trim12aQ99PQ1 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Trim12aQ99PQ1 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Trim12aQ99PQ1 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Trim12aQ99PQ1 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Trim12aQ99PQ1 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Trim12aQ99PQ1 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Trim12aQ99PQ1 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Trim12aQ99PQ1 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Trim12aQ99PQ1 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Trim12aQ99PQ1 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Trim12aQ99PQ1 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Trim12aQ99PQ1 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Trim12aQ99PQ1 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
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