Protein–RNA interactions for Protein: Q99PE5

Smim3, Small integral membrane protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 60 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim3Q99PE5 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Smim3Q99PE5 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Smim3Q99PE5 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Smim3Q99PE5 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Smim3Q99PE5 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Smim3Q99PE5 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Smim3Q99PE5 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Smim3Q99PE5 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Smim3Q99PE5 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Smim3Q99PE5 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Smim3Q99PE5 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Smim3Q99PE5 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Smim3Q99PE5 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Smim3Q99PE5 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Smim3Q99PE5 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Smim3Q99PE5 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Smim3Q99PE5 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Smim3Q99PE5 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Smim3Q99PE5 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Smim3Q99PE5 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Smim3Q99PE5 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Smim3Q99PE5 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Smim3Q99PE5 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Smim3Q99PE5 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Smim3Q99PE5 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Smim3Q99PE5 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Smim3Q99PE5 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Smim3Q99PE5 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Smim3Q99PE5 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Smim3Q99PE5 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Smim3Q99PE5 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Smim3Q99PE5 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Smim3Q99PE5 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Smim3Q99PE5 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Smim3Q99PE5 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Smim3Q99PE5 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Smim3Q99PE5 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Smim3Q99PE5 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Smim3Q99PE5 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Smim3Q99PE5 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Smim3Q99PE5 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Smim3Q99PE5 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Smim3Q99PE5 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Smim3Q99PE5 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Smim3Q99PE5 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Smim3Q99PE5 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Smim3Q99PE5 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Smim3Q99PE5 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Smim3Q99PE5 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Smim3Q99PE5 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Smim3Q99PE5 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Smim3Q99PE5 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Smim3Q99PE5 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Smim3Q99PE5 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Smim3Q99PE5 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Smim3Q99PE5 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Smim3Q99PE5 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Smim3Q99PE5 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Smim3Q99PE5 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Smim3Q99PE5 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Smim3Q99PE5 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Smim3Q99PE5 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Smim3Q99PE5 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Smim3Q99PE5 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Smim3Q99PE5 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Smim3Q99PE5 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Smim3Q99PE5 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Smim3Q99PE5 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Smim3Q99PE5 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Smim3Q99PE5 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Smim3Q99PE5 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Smim3Q99PE5 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Smim3Q99PE5 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Smim3Q99PE5 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Smim3Q99PE5 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Smim3Q99PE5 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Smim3Q99PE5 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Smim3Q99PE5 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Smim3Q99PE5 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Smim3Q99PE5 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Smim3Q99PE5 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Smim3Q99PE5 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Smim3Q99PE5 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Smim3Q99PE5 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Smim3Q99PE5 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Smim3Q99PE5 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Smim3Q99PE5 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Smim3Q99PE5 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Smim3Q99PE5 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Smim3Q99PE5 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Smim3Q99PE5 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Smim3Q99PE5 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Smim3Q99PE5 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Smim3Q99PE5 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Smim3Q99PE5 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Smim3Q99PE5 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Smim3Q99PE5 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Smim3Q99PE5 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Smim3Q99PE5 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Smim3Q99PE5 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.5 ms