Protein–RNA interactions for Protein: Q99NH8

Trem2, Triggering receptor expressed on myeloid cells 2, mousemouse

Predictions only

Length 227 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trem2Q99NH8 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Trem2Q99NH8 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Trem2Q99NH8 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Trem2Q99NH8 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Trem2Q99NH8 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Trem2Q99NH8 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Trem2Q99NH8 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Trem2Q99NH8 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Trem2Q99NH8 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Trem2Q99NH8 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Trem2Q99NH8 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Trem2Q99NH8 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Trem2Q99NH8 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Trem2Q99NH8 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Trem2Q99NH8 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Trem2Q99NH8 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Trem2Q99NH8 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Trem2Q99NH8 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Trem2Q99NH8 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Trem2Q99NH8 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Trem2Q99NH8 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Trem2Q99NH8 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Trem2Q99NH8 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Trem2Q99NH8 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Trem2Q99NH8 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Trem2Q99NH8 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Trem2Q99NH8 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Trem2Q99NH8 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Trem2Q99NH8 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Trem2Q99NH8 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Trem2Q99NH8 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Trem2Q99NH8 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Trem2Q99NH8 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Trem2Q99NH8 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Trem2Q99NH8 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Trem2Q99NH8 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Trem2Q99NH8 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Trem2Q99NH8 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Trem2Q99NH8 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Trem2Q99NH8 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Trem2Q99NH8 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Trem2Q99NH8 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Trem2Q99NH8 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Trem2Q99NH8 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Trem2Q99NH8 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Trem2Q99NH8 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Trem2Q99NH8 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Trem2Q99NH8 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Trem2Q99NH8 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Trem2Q99NH8 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Trem2Q99NH8 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Trem2Q99NH8 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Trem2Q99NH8 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Trem2Q99NH8 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Trem2Q99NH8 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Trem2Q99NH8 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Trem2Q99NH8 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Trem2Q99NH8 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Trem2Q99NH8 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Trem2Q99NH8 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Trem2Q99NH8 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Trem2Q99NH8 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Trem2Q99NH8 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Trem2Q99NH8 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Trem2Q99NH8 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Trem2Q99NH8 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Trem2Q99NH8 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Trem2Q99NH8 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Trem2Q99NH8 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Trem2Q99NH8 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Trem2Q99NH8 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Trem2Q99NH8 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Trem2Q99NH8 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Trem2Q99NH8 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Trem2Q99NH8 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Trem2Q99NH8 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Trem2Q99NH8 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Trem2Q99NH8 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Trem2Q99NH8 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Trem2Q99NH8 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Trem2Q99NH8 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Trem2Q99NH8 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Trem2Q99NH8 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Trem2Q99NH8 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Trem2Q99NH8 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Trem2Q99NH8 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Trem2Q99NH8 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Trem2Q99NH8 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Trem2Q99NH8 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Trem2Q99NH8 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Trem2Q99NH8 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Trem2Q99NH8 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Trem2Q99NH8 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Trem2Q99NH8 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Trem2Q99NH8 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Trem2Q99NH8 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Trem2Q99NH8 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Trem2Q99NH8 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Trem2Q99NH8 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Trem2Q99NH8 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.1 ms