Protein–RNA interactions for Protein: Q99M80

Ptprt, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase T, mousemouse

Predictions only

Length 1,454 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprtQ99M80 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
PtprtQ99M80 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
PtprtQ99M80 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
PtprtQ99M80 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
PtprtQ99M80 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
PtprtQ99M80 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
PtprtQ99M80 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
PtprtQ99M80 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
PtprtQ99M80 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
PtprtQ99M80 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
PtprtQ99M80 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
PtprtQ99M80 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
PtprtQ99M80 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC27.39■■□□□ 1.98
PtprtQ99M80 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC27.39■■□□□ 1.98
PtprtQ99M80 Timm13-203ENSMUST00000218481 471 ntTSL 3 BASIC27.39■■□□□ 1.98
PtprtQ99M80 Sf3b6-201ENSMUST00000046207 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
PtprtQ99M80 1600017P15Rik-201ENSMUST00000083427 412 ntBASIC27.39■■□□□ 1.98
PtprtQ99M80 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
PtprtQ99M80 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC27.39■■□□□ 1.98
PtprtQ99M80 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
PtprtQ99M80 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
PtprtQ99M80 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
PtprtQ99M80 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
PtprtQ99M80 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
PtprtQ99M80 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
PtprtQ99M80 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC27.38■■□□□ 1.97
PtprtQ99M80 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC27.38■■□□□ 1.97
PtprtQ99M80 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
PtprtQ99M80 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
PtprtQ99M80 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
PtprtQ99M80 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
PtprtQ99M80 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
PtprtQ99M80 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
PtprtQ99M80 Gm2213-201ENSMUST00000197485 688 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
PtprtQ99M80 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
PtprtQ99M80 Cda-201ENSMUST00000030535 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
PtprtQ99M80 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
PtprtQ99M80 Gm9925-201ENSMUST00000066583 483 ntAPPRIS P1 BASIC27.38■■□□□ 1.97
PtprtQ99M80 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
PtprtQ99M80 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
PtprtQ99M80 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
PtprtQ99M80 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
PtprtQ99M80 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
PtprtQ99M80 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC27.37■■□□□ 1.97
PtprtQ99M80 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
PtprtQ99M80 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
PtprtQ99M80 Dpf3-205ENSMUST00000177801 1092 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
PtprtQ99M80 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
PtprtQ99M80 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
PtprtQ99M80 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
PtprtQ99M80 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
PtprtQ99M80 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
PtprtQ99M80 1700025N23Rik-201ENSMUST00000186189 915 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
PtprtQ99M80 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
PtprtQ99M80 Atp6v0b-201ENSMUST00000036380 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
PtprtQ99M80 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
PtprtQ99M80 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
PtprtQ99M80 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
PtprtQ99M80 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
PtprtQ99M80 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
PtprtQ99M80 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC27.35■■□□□ 1.97
PtprtQ99M80 Gm33054-201ENSMUST00000216588 313 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
PtprtQ99M80 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
PtprtQ99M80 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
PtprtQ99M80 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
PtprtQ99M80 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
PtprtQ99M80 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
PtprtQ99M80 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
PtprtQ99M80 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
PtprtQ99M80 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
PtprtQ99M80 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
PtprtQ99M80 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
PtprtQ99M80 Gm43575-201ENSMUST00000196420 516 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
PtprtQ99M80 Zfp787-205ENSMUST00000207957 880 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
PtprtQ99M80 Gm5186-201ENSMUST00000218781 920 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
PtprtQ99M80 AC161829.1-201ENSMUST00000220298 281 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
PtprtQ99M80 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
PtprtQ99M80 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
PtprtQ99M80 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
PtprtQ99M80 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
PtprtQ99M80 Rplp2-203ENSMUST00000106004 421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
PtprtQ99M80 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC27.32■■□□□ 1.96
PtprtQ99M80 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
PtprtQ99M80 Auts2-212ENSMUST00000178555 309 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
PtprtQ99M80 AC138767.1-201ENSMUST00000222661 415 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
PtprtQ99M80 Mrpl34-201ENSMUST00000048914 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
PtprtQ99M80 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
PtprtQ99M80 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
PtprtQ99M80 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
PtprtQ99M80 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
PtprtQ99M80 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
PtprtQ99M80 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
PtprtQ99M80 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
PtprtQ99M80 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
PtprtQ99M80 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
PtprtQ99M80 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
PtprtQ99M80 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
PtprtQ99M80 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC27.32■■□□□ 1.96
PtprtQ99M80 Ndufb7-201ENSMUST00000036996 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
PtprtQ99M80 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
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