Protein–RNA interactions for Protein: Q99LU0

Chmp1b1, Charged multivesicular body protein 1b-1, mousemouse

Predictions only

Length 199 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chmp1b1Q99LU0 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Chmp1b1Q99LU0 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Chmp1b1Q99LU0 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Chmp1b1Q99LU0 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Chmp1b1Q99LU0 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Chmp1b1Q99LU0 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Chmp1b1Q99LU0 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Chmp1b1Q99LU0 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Chmp1b1Q99LU0 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Chmp1b1Q99LU0 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Chmp1b1Q99LU0 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Chmp1b1Q99LU0 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Chmp1b1Q99LU0 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Chmp1b1Q99LU0 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Chmp1b1Q99LU0 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Chmp1b1Q99LU0 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Chmp1b1Q99LU0 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Chmp1b1Q99LU0 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC16.96■□□□□ 0.3
Chmp1b1Q99LU0 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Chmp1b1Q99LU0 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Chmp1b1Q99LU0 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
Chmp1b1Q99LU0 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Chmp1b1Q99LU0 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
Chmp1b1Q99LU0 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Chmp1b1Q99LU0 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Chmp1b1Q99LU0 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Chmp1b1Q99LU0 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Chmp1b1Q99LU0 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Chmp1b1Q99LU0 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Chmp1b1Q99LU0 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Chmp1b1Q99LU0 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Chmp1b1Q99LU0 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Chmp1b1Q99LU0 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Chmp1b1Q99LU0 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Chmp1b1Q99LU0 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Chmp1b1Q99LU0 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Chmp1b1Q99LU0 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Chmp1b1Q99LU0 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Chmp1b1Q99LU0 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Chmp1b1Q99LU0 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Chmp1b1Q99LU0 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Chmp1b1Q99LU0 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Chmp1b1Q99LU0 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Chmp1b1Q99LU0 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Chmp1b1Q99LU0 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Chmp1b1Q99LU0 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Chmp1b1Q99LU0 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Chmp1b1Q99LU0 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Chmp1b1Q99LU0 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Chmp1b1Q99LU0 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Chmp1b1Q99LU0 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Chmp1b1Q99LU0 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Chmp1b1Q99LU0 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Chmp1b1Q99LU0 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Chmp1b1Q99LU0 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Chmp1b1Q99LU0 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Chmp1b1Q99LU0 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Chmp1b1Q99LU0 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Chmp1b1Q99LU0 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Chmp1b1Q99LU0 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Chmp1b1Q99LU0 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Chmp1b1Q99LU0 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Chmp1b1Q99LU0 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Chmp1b1Q99LU0 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Chmp1b1Q99LU0 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Chmp1b1Q99LU0 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Chmp1b1Q99LU0 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Chmp1b1Q99LU0 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Chmp1b1Q99LU0 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Chmp1b1Q99LU0 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Chmp1b1Q99LU0 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Chmp1b1Q99LU0 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Chmp1b1Q99LU0 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Chmp1b1Q99LU0 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Chmp1b1Q99LU0 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Chmp1b1Q99LU0 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Chmp1b1Q99LU0 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Chmp1b1Q99LU0 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Chmp1b1Q99LU0 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Chmp1b1Q99LU0 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
Chmp1b1Q99LU0 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Chmp1b1Q99LU0 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Chmp1b1Q99LU0 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Chmp1b1Q99LU0 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Chmp1b1Q99LU0 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Chmp1b1Q99LU0 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Chmp1b1Q99LU0 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Chmp1b1Q99LU0 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Chmp1b1Q99LU0 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
Chmp1b1Q99LU0 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Chmp1b1Q99LU0 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Chmp1b1Q99LU0 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Chmp1b1Q99LU0 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Chmp1b1Q99LU0 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Chmp1b1Q99LU0 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Chmp1b1Q99LU0 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Chmp1b1Q99LU0 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Chmp1b1Q99LU0 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Chmp1b1Q99LU0 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Chmp1b1Q99LU0 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.3 ms