Protein–RNA interactions for Protein: Q99KI3

Emc3, ER membrane protein complex subunit 3, mousemouse

Predictions only

Length 261 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Emc3Q99KI3 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Emc3Q99KI3 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Emc3Q99KI3 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Emc3Q99KI3 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Emc3Q99KI3 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Emc3Q99KI3 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Emc3Q99KI3 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Emc3Q99KI3 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Emc3Q99KI3 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Emc3Q99KI3 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Emc3Q99KI3 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Emc3Q99KI3 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Emc3Q99KI3 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Emc3Q99KI3 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Emc3Q99KI3 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Emc3Q99KI3 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Emc3Q99KI3 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Emc3Q99KI3 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Emc3Q99KI3 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Emc3Q99KI3 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Emc3Q99KI3 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Emc3Q99KI3 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Emc3Q99KI3 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Emc3Q99KI3 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Emc3Q99KI3 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Emc3Q99KI3 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Emc3Q99KI3 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Emc3Q99KI3 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Emc3Q99KI3 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Emc3Q99KI3 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Emc3Q99KI3 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Emc3Q99KI3 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Emc3Q99KI3 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Emc3Q99KI3 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Emc3Q99KI3 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Emc3Q99KI3 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Emc3Q99KI3 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Emc3Q99KI3 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Emc3Q99KI3 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Emc3Q99KI3 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Emc3Q99KI3 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Emc3Q99KI3 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Emc3Q99KI3 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Emc3Q99KI3 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Emc3Q99KI3 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Emc3Q99KI3 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Emc3Q99KI3 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Emc3Q99KI3 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Emc3Q99KI3 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Emc3Q99KI3 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Emc3Q99KI3 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Emc3Q99KI3 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Emc3Q99KI3 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Emc3Q99KI3 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Emc3Q99KI3 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Emc3Q99KI3 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Emc3Q99KI3 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Emc3Q99KI3 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Emc3Q99KI3 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Emc3Q99KI3 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Emc3Q99KI3 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Emc3Q99KI3 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Emc3Q99KI3 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Emc3Q99KI3 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Emc3Q99KI3 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Emc3Q99KI3 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Emc3Q99KI3 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Emc3Q99KI3 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Emc3Q99KI3 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Emc3Q99KI3 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Emc3Q99KI3 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Emc3Q99KI3 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Emc3Q99KI3 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Emc3Q99KI3 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Emc3Q99KI3 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Emc3Q99KI3 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Emc3Q99KI3 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Emc3Q99KI3 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Emc3Q99KI3 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Emc3Q99KI3 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Emc3Q99KI3 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Emc3Q99KI3 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Emc3Q99KI3 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Emc3Q99KI3 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Emc3Q99KI3 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Emc3Q99KI3 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Emc3Q99KI3 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Emc3Q99KI3 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Emc3Q99KI3 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Emc3Q99KI3 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Emc3Q99KI3 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Emc3Q99KI3 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Emc3Q99KI3 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Emc3Q99KI3 Gbp5-201ENSMUST00000090127 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Emc3Q99KI3 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Emc3Q99KI3 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Emc3Q99KI3 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Emc3Q99KI3 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Emc3Q99KI3 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Emc3Q99KI3 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.2 ms