Protein–RNA interactions for Protein: Q99KF1

Tmed9, Transmembrane emp24 domain-containing protein 9, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 235 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmed9Q99KF1 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Tmed9Q99KF1 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tmed9Q99KF1 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tmed9Q99KF1 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tmed9Q99KF1 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tmed9Q99KF1 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tmed9Q99KF1 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Tmed9Q99KF1 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tmed9Q99KF1 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tmed9Q99KF1 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tmed9Q99KF1 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tmed9Q99KF1 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tmed9Q99KF1 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tmed9Q99KF1 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tmed9Q99KF1 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tmed9Q99KF1 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tmed9Q99KF1 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tmed9Q99KF1 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tmed9Q99KF1 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tmed9Q99KF1 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tmed9Q99KF1 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tmed9Q99KF1 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tmed9Q99KF1 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tmed9Q99KF1 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tmed9Q99KF1 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Tmed9Q99KF1 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tmed9Q99KF1 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tmed9Q99KF1 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tmed9Q99KF1 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tmed9Q99KF1 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tmed9Q99KF1 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tmed9Q99KF1 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tmed9Q99KF1 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tmed9Q99KF1 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tmed9Q99KF1 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Tmed9Q99KF1 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tmed9Q99KF1 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tmed9Q99KF1 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tmed9Q99KF1 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tmed9Q99KF1 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tmed9Q99KF1 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tmed9Q99KF1 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Tmed9Q99KF1 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Tmed9Q99KF1 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tmed9Q99KF1 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tmed9Q99KF1 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tmed9Q99KF1 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tmed9Q99KF1 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tmed9Q99KF1 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Tmed9Q99KF1 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tmed9Q99KF1 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tmed9Q99KF1 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tmed9Q99KF1 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tmed9Q99KF1 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tmed9Q99KF1 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tmed9Q99KF1 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tmed9Q99KF1 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tmed9Q99KF1 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tmed9Q99KF1 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tmed9Q99KF1 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tmed9Q99KF1 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tmed9Q99KF1 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Tmed9Q99KF1 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tmed9Q99KF1 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tmed9Q99KF1 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tmed9Q99KF1 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tmed9Q99KF1 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tmed9Q99KF1 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tmed9Q99KF1 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tmed9Q99KF1 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tmed9Q99KF1 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tmed9Q99KF1 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tmed9Q99KF1 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tmed9Q99KF1 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tmed9Q99KF1 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Tmed9Q99KF1 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Tmed9Q99KF1 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Tmed9Q99KF1 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tmed9Q99KF1 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tmed9Q99KF1 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Tmed9Q99KF1 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tmed9Q99KF1 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tmed9Q99KF1 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tmed9Q99KF1 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tmed9Q99KF1 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tmed9Q99KF1 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tmed9Q99KF1 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tmed9Q99KF1 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tmed9Q99KF1 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tmed9Q99KF1 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tmed9Q99KF1 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tmed9Q99KF1 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tmed9Q99KF1 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tmed9Q99KF1 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tmed9Q99KF1 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tmed9Q99KF1 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tmed9Q99KF1 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Tmed9Q99KF1 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tmed9Q99KF1 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tmed9Q99KF1 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21 ms