Protein–RNA interactions for Protein: Q99388

Csprs, Component of Sp100-rs, mousemouse

Predictions only

Length 208 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CsprsQ99388 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CsprsQ99388 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CsprsQ99388 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CsprsQ99388 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CsprsQ99388 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CsprsQ99388 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CsprsQ99388 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CsprsQ99388 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CsprsQ99388 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CsprsQ99388 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CsprsQ99388 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CsprsQ99388 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CsprsQ99388 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CsprsQ99388 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CsprsQ99388 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CsprsQ99388 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CsprsQ99388 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CsprsQ99388 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CsprsQ99388 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CsprsQ99388 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CsprsQ99388 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CsprsQ99388 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CsprsQ99388 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CsprsQ99388 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CsprsQ99388 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CsprsQ99388 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CsprsQ99388 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
CsprsQ99388 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CsprsQ99388 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CsprsQ99388 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CsprsQ99388 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CsprsQ99388 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CsprsQ99388 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CsprsQ99388 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CsprsQ99388 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CsprsQ99388 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
CsprsQ99388 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CsprsQ99388 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CsprsQ99388 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.07
CsprsQ99388 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CsprsQ99388 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CsprsQ99388 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
CsprsQ99388 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CsprsQ99388 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CsprsQ99388 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CsprsQ99388 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CsprsQ99388 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CsprsQ99388 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CsprsQ99388 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CsprsQ99388 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CsprsQ99388 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CsprsQ99388 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
CsprsQ99388 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CsprsQ99388 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CsprsQ99388 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CsprsQ99388 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CsprsQ99388 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CsprsQ99388 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CsprsQ99388 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CsprsQ99388 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CsprsQ99388 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CsprsQ99388 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CsprsQ99388 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CsprsQ99388 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CsprsQ99388 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CsprsQ99388 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CsprsQ99388 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CsprsQ99388 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CsprsQ99388 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CsprsQ99388 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CsprsQ99388 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CsprsQ99388 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CsprsQ99388 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CsprsQ99388 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CsprsQ99388 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CsprsQ99388 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CsprsQ99388 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
CsprsQ99388 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CsprsQ99388 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CsprsQ99388 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CsprsQ99388 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CsprsQ99388 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CsprsQ99388 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CsprsQ99388 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CsprsQ99388 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CsprsQ99388 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CsprsQ99388 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CsprsQ99388 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CsprsQ99388 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CsprsQ99388 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CsprsQ99388 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CsprsQ99388 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CsprsQ99388 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CsprsQ99388 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CsprsQ99388 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CsprsQ99388 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CsprsQ99388 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CsprsQ99388 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CsprsQ99388 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CsprsQ99388 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.8 ms