Protein–RNA interactions for Protein: Q925N4

Cldn16, Claudin-16, mousemouse

Predictions only

Length 235 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn16Q925N4 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Cldn16Q925N4 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Cldn16Q925N4 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Cldn16Q925N4 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Cldn16Q925N4 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Cldn16Q925N4 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Cldn16Q925N4 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Cldn16Q925N4 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Cldn16Q925N4 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Cldn16Q925N4 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Cldn16Q925N4 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Cldn16Q925N4 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Cldn16Q925N4 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Cldn16Q925N4 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Cldn16Q925N4 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Cldn16Q925N4 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Cldn16Q925N4 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Cldn16Q925N4 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Cldn16Q925N4 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Cldn16Q925N4 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Cldn16Q925N4 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Cldn16Q925N4 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Cldn16Q925N4 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Cldn16Q925N4 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Cldn16Q925N4 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Cldn16Q925N4 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Cldn16Q925N4 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Cldn16Q925N4 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Cldn16Q925N4 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Cldn16Q925N4 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Cldn16Q925N4 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Cldn16Q925N4 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Cldn16Q925N4 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Cldn16Q925N4 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Cldn16Q925N4 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Cldn16Q925N4 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Cldn16Q925N4 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Cldn16Q925N4 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Cldn16Q925N4 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Cldn16Q925N4 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Cldn16Q925N4 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Cldn16Q925N4 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Cldn16Q925N4 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Cldn16Q925N4 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Cldn16Q925N4 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Cldn16Q925N4 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC14.22□□□□□ -0.13
Cldn16Q925N4 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC14.22□□□□□ -0.13
Cldn16Q925N4 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Cldn16Q925N4 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Cldn16Q925N4 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Cldn16Q925N4 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Cldn16Q925N4 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Cldn16Q925N4 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC14.22□□□□□ -0.13
Cldn16Q925N4 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Cldn16Q925N4 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Cldn16Q925N4 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Cldn16Q925N4 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Cldn16Q925N4 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Cldn16Q925N4 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Cldn16Q925N4 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Cldn16Q925N4 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Cldn16Q925N4 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Cldn16Q925N4 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Cldn16Q925N4 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Cldn16Q925N4 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Cldn16Q925N4 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Cldn16Q925N4 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC14.21□□□□□ -0.13
Cldn16Q925N4 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Cldn16Q925N4 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Cldn16Q925N4 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Cldn16Q925N4 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Cldn16Q925N4 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Cldn16Q925N4 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC14.21□□□□□ -0.13
Cldn16Q925N4 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC14.21□□□□□ -0.14
Cldn16Q925N4 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
Cldn16Q925N4 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
Cldn16Q925N4 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC14.21□□□□□ -0.14
Cldn16Q925N4 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
Cldn16Q925N4 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.14
Cldn16Q925N4 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Cldn16Q925N4 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Cldn16Q925N4 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Cldn16Q925N4 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Cldn16Q925N4 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Cldn16Q925N4 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Cldn16Q925N4 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Cldn16Q925N4 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Cldn16Q925N4 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Cldn16Q925N4 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Cldn16Q925N4 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Cldn16Q925N4 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Cldn16Q925N4 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Cldn16Q925N4 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Cldn16Q925N4 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Cldn16Q925N4 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Cldn16Q925N4 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Cldn16Q925N4 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Cldn16Q925N4 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Cldn16Q925N4 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Cldn16Q925N4 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
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