Protein–RNA interactions for Protein: Q924S9

Ripply3, Protein ripply3, mousemouse

Predictions only

Length 152 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ripply3Q924S9 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ripply3Q924S9 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ripply3Q924S9 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ripply3Q924S9 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ripply3Q924S9 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ripply3Q924S9 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ripply3Q924S9 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ripply3Q924S9 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ripply3Q924S9 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ripply3Q924S9 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ripply3Q924S9 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ripply3Q924S9 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ripply3Q924S9 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ripply3Q924S9 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Ripply3Q924S9 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Ripply3Q924S9 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ripply3Q924S9 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ripply3Q924S9 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ripply3Q924S9 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ripply3Q924S9 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ripply3Q924S9 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Ripply3Q924S9 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Ripply3Q924S9 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Ripply3Q924S9 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ripply3Q924S9 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ripply3Q924S9 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ripply3Q924S9 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ripply3Q924S9 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ripply3Q924S9 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ripply3Q924S9 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ripply3Q924S9 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ripply3Q924S9 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ripply3Q924S9 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ripply3Q924S9 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ripply3Q924S9 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ripply3Q924S9 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ripply3Q924S9 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ripply3Q924S9 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ripply3Q924S9 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ripply3Q924S9 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ripply3Q924S9 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ripply3Q924S9 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ripply3Q924S9 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ripply3Q924S9 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ripply3Q924S9 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ripply3Q924S9 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ripply3Q924S9 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ripply3Q924S9 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ripply3Q924S9 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ripply3Q924S9 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ripply3Q924S9 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ripply3Q924S9 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ripply3Q924S9 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ripply3Q924S9 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Ripply3Q924S9 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ripply3Q924S9 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ripply3Q924S9 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ripply3Q924S9 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ripply3Q924S9 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ripply3Q924S9 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ripply3Q924S9 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ripply3Q924S9 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ripply3Q924S9 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ripply3Q924S9 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ripply3Q924S9 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ripply3Q924S9 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ripply3Q924S9 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ripply3Q924S9 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ripply3Q924S9 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ripply3Q924S9 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ripply3Q924S9 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ripply3Q924S9 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ripply3Q924S9 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ripply3Q924S9 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ripply3Q924S9 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ripply3Q924S9 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ripply3Q924S9 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ripply3Q924S9 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ripply3Q924S9 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ripply3Q924S9 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ripply3Q924S9 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ripply3Q924S9 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ripply3Q924S9 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ripply3Q924S9 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Ripply3Q924S9 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ripply3Q924S9 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ripply3Q924S9 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ripply3Q924S9 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ripply3Q924S9 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ripply3Q924S9 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Ripply3Q924S9 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ripply3Q924S9 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ripply3Q924S9 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ripply3Q924S9 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ripply3Q924S9 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ripply3Q924S9 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ripply3Q924S9 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ripply3Q924S9 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ripply3Q924S9 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ripply3Q924S9 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.3 ms