Protein–RNA interactions for Protein: Q923B3

Nrif1, Neurotrophin receptor-interacting factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 828 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nrif1Q923B3 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Nrif1Q923B3 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Nrif1Q923B3 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Nrif1Q923B3 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Nrif1Q923B3 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Nrif1Q923B3 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Nrif1Q923B3 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Nrif1Q923B3 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Nrif1Q923B3 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Nrif1Q923B3 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Nrif1Q923B3 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.46
Nrif1Q923B3 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.46
Nrif1Q923B3 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Nrif1Q923B3 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Nrif1Q923B3 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Nrif1Q923B3 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Nrif1Q923B3 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Nrif1Q923B3 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Nrif1Q923B3 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Nrif1Q923B3 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Nrif1Q923B3 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Nrif1Q923B3 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Nrif1Q923B3 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Nrif1Q923B3 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Nrif1Q923B3 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Nrif1Q923B3 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Nrif1Q923B3 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Nrif1Q923B3 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Nrif1Q923B3 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Nrif1Q923B3 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Nrif1Q923B3 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Nrif1Q923B3 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Nrif1Q923B3 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Nrif1Q923B3 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Nrif1Q923B3 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Nrif1Q923B3 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Nrif1Q923B3 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Nrif1Q923B3 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Nrif1Q923B3 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Nrif1Q923B3 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Nrif1Q923B3 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Nrif1Q923B3 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Nrif1Q923B3 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Nrif1Q923B3 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Nrif1Q923B3 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Nrif1Q923B3 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Nrif1Q923B3 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Nrif1Q923B3 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Nrif1Q923B3 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Nrif1Q923B3 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Nrif1Q923B3 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Nrif1Q923B3 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Nrif1Q923B3 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Nrif1Q923B3 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Nrif1Q923B3 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Nrif1Q923B3 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Nrif1Q923B3 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Nrif1Q923B3 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Nrif1Q923B3 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Nrif1Q923B3 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Nrif1Q923B3 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Nrif1Q923B3 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Nrif1Q923B3 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Nrif1Q923B3 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Nrif1Q923B3 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Nrif1Q923B3 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Nrif1Q923B3 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Nrif1Q923B3 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Nrif1Q923B3 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Nrif1Q923B3 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Nrif1Q923B3 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Nrif1Q923B3 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Nrif1Q923B3 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Nrif1Q923B3 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Nrif1Q923B3 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Nrif1Q923B3 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Nrif1Q923B3 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Nrif1Q923B3 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Nrif1Q923B3 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Nrif1Q923B3 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Nrif1Q923B3 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Nrif1Q923B3 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Nrif1Q923B3 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Nrif1Q923B3 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Nrif1Q923B3 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Nrif1Q923B3 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Nrif1Q923B3 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Nrif1Q923B3 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Nrif1Q923B3 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Nrif1Q923B3 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Nrif1Q923B3 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Nrif1Q923B3 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Nrif1Q923B3 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Nrif1Q923B3 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Nrif1Q923B3 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Nrif1Q923B3 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Nrif1Q923B3 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Nrif1Q923B3 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Nrif1Q923B3 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Nrif1Q923B3 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.8 ms