Protein–RNA interactions for Protein: Q91ZD5

Cts3, Cathepsin-3, mousemouse

Predictions only

Length 332 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cts3Q91ZD5 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Cts3Q91ZD5 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Cts3Q91ZD5 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Cts3Q91ZD5 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Cts3Q91ZD5 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Cts3Q91ZD5 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Cts3Q91ZD5 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Cts3Q91ZD5 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Cts3Q91ZD5 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Cts3Q91ZD5 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Cts3Q91ZD5 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Cts3Q91ZD5 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Cts3Q91ZD5 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Cts3Q91ZD5 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Cts3Q91ZD5 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Cts3Q91ZD5 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cts3Q91ZD5 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cts3Q91ZD5 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cts3Q91ZD5 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cts3Q91ZD5 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cts3Q91ZD5 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cts3Q91ZD5 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Cts3Q91ZD5 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cts3Q91ZD5 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cts3Q91ZD5 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Cts3Q91ZD5 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cts3Q91ZD5 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cts3Q91ZD5 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cts3Q91ZD5 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cts3Q91ZD5 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cts3Q91ZD5 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cts3Q91ZD5 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cts3Q91ZD5 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cts3Q91ZD5 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cts3Q91ZD5 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cts3Q91ZD5 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cts3Q91ZD5 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cts3Q91ZD5 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cts3Q91ZD5 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cts3Q91ZD5 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cts3Q91ZD5 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cts3Q91ZD5 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cts3Q91ZD5 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cts3Q91ZD5 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cts3Q91ZD5 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Cts3Q91ZD5 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Cts3Q91ZD5 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Cts3Q91ZD5 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Cts3Q91ZD5 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Cts3Q91ZD5 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Cts3Q91ZD5 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Cts3Q91ZD5 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Cts3Q91ZD5 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Cts3Q91ZD5 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Cts3Q91ZD5 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Cts3Q91ZD5 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Cts3Q91ZD5 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Cts3Q91ZD5 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Cts3Q91ZD5 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Cts3Q91ZD5 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Cts3Q91ZD5 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Cts3Q91ZD5 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Cts3Q91ZD5 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Cts3Q91ZD5 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Cts3Q91ZD5 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Cts3Q91ZD5 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Cts3Q91ZD5 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Cts3Q91ZD5 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.46
Cts3Q91ZD5 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Cts3Q91ZD5 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Cts3Q91ZD5 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Cts3Q91ZD5 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Cts3Q91ZD5 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Cts3Q91ZD5 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Cts3Q91ZD5 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Cts3Q91ZD5 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Cts3Q91ZD5 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Cts3Q91ZD5 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Cts3Q91ZD5 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Cts3Q91ZD5 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Cts3Q91ZD5 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Cts3Q91ZD5 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Cts3Q91ZD5 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Cts3Q91ZD5 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Cts3Q91ZD5 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Cts3Q91ZD5 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Cts3Q91ZD5 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Cts3Q91ZD5 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Cts3Q91ZD5 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Cts3Q91ZD5 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Cts3Q91ZD5 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Cts3Q91ZD5 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Cts3Q91ZD5 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Cts3Q91ZD5 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Cts3Q91ZD5 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Cts3Q91ZD5 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Cts3Q91ZD5 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Cts3Q91ZD5 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Cts3Q91ZD5 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Cts3Q91ZD5 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.5 ms