Protein–RNA interactions for Protein: Q8VC31

Ccdc9, Coiled-coil domain-containing protein 9, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 543 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc9Q8VC31 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ccdc9Q8VC31 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ccdc9Q8VC31 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ccdc9Q8VC31 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ccdc9Q8VC31 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ccdc9Q8VC31 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ccdc9Q8VC31 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ccdc9Q8VC31 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ccdc9Q8VC31 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ccdc9Q8VC31 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ccdc9Q8VC31 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ccdc9Q8VC31 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ccdc9Q8VC31 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ccdc9Q8VC31 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ccdc9Q8VC31 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ccdc9Q8VC31 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ccdc9Q8VC31 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ccdc9Q8VC31 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ccdc9Q8VC31 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ccdc9Q8VC31 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ccdc9Q8VC31 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ccdc9Q8VC31 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ccdc9Q8VC31 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ccdc9Q8VC31 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ccdc9Q8VC31 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ccdc9Q8VC31 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ccdc9Q8VC31 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ccdc9Q8VC31 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Ccdc9Q8VC31 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Ccdc9Q8VC31 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Ccdc9Q8VC31 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Ccdc9Q8VC31 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Ccdc9Q8VC31 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Ccdc9Q8VC31 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Ccdc9Q8VC31 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Ccdc9Q8VC31 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Ccdc9Q8VC31 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Ccdc9Q8VC31 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Ccdc9Q8VC31 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Ccdc9Q8VC31 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Ccdc9Q8VC31 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ccdc9Q8VC31 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ccdc9Q8VC31 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ccdc9Q8VC31 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ccdc9Q8VC31 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ccdc9Q8VC31 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ccdc9Q8VC31 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ccdc9Q8VC31 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ccdc9Q8VC31 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ccdc9Q8VC31 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ccdc9Q8VC31 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ccdc9Q8VC31 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ccdc9Q8VC31 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ccdc9Q8VC31 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ccdc9Q8VC31 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ccdc9Q8VC31 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ccdc9Q8VC31 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ccdc9Q8VC31 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ccdc9Q8VC31 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ccdc9Q8VC31 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ccdc9Q8VC31 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ccdc9Q8VC31 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
Ccdc9Q8VC31 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ccdc9Q8VC31 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ccdc9Q8VC31 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ccdc9Q8VC31 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ccdc9Q8VC31 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ccdc9Q8VC31 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ccdc9Q8VC31 Gbp5-201ENSMUST00000090127 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ccdc9Q8VC31 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ccdc9Q8VC31 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ccdc9Q8VC31 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ccdc9Q8VC31 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ccdc9Q8VC31 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ccdc9Q8VC31 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ccdc9Q8VC31 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ccdc9Q8VC31 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ccdc9Q8VC31 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ccdc9Q8VC31 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ccdc9Q8VC31 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ccdc9Q8VC31 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ccdc9Q8VC31 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ccdc9Q8VC31 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ccdc9Q8VC31 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ccdc9Q8VC31 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ccdc9Q8VC31 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ccdc9Q8VC31 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ccdc9Q8VC31 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ccdc9Q8VC31 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ccdc9Q8VC31 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ccdc9Q8VC31 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ccdc9Q8VC31 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ccdc9Q8VC31 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ccdc9Q8VC31 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Ccdc9Q8VC31 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ccdc9Q8VC31 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ccdc9Q8VC31 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Ccdc9Q8VC31 Cep44-201ENSMUST00000040330 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ccdc9Q8VC31 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ccdc9Q8VC31 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.2 ms