Protein–RNA interactions for Protein: Q8VBT6

Apobr, Apolipoprotein B receptor, mousemouse

Predictions only

Length 942 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ApobrQ8VBT6 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ApobrQ8VBT6 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
ApobrQ8VBT6 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.25
ApobrQ8VBT6 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
ApobrQ8VBT6 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
ApobrQ8VBT6 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
ApobrQ8VBT6 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
ApobrQ8VBT6 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
ApobrQ8VBT6 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
ApobrQ8VBT6 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
ApobrQ8VBT6 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
ApobrQ8VBT6 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
ApobrQ8VBT6 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
ApobrQ8VBT6 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
ApobrQ8VBT6 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ApobrQ8VBT6 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ApobrQ8VBT6 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ApobrQ8VBT6 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ApobrQ8VBT6 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ApobrQ8VBT6 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ApobrQ8VBT6 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ApobrQ8VBT6 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ApobrQ8VBT6 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ApobrQ8VBT6 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ApobrQ8VBT6 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ApobrQ8VBT6 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ApobrQ8VBT6 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ApobrQ8VBT6 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ApobrQ8VBT6 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ApobrQ8VBT6 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ApobrQ8VBT6 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ApobrQ8VBT6 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ApobrQ8VBT6 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ApobrQ8VBT6 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ApobrQ8VBT6 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ApobrQ8VBT6 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
ApobrQ8VBT6 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
ApobrQ8VBT6 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ApobrQ8VBT6 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ApobrQ8VBT6 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ApobrQ8VBT6 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ApobrQ8VBT6 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ApobrQ8VBT6 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ApobrQ8VBT6 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ApobrQ8VBT6 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ApobrQ8VBT6 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ApobrQ8VBT6 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
ApobrQ8VBT6 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ApobrQ8VBT6 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ApobrQ8VBT6 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
ApobrQ8VBT6 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ApobrQ8VBT6 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
ApobrQ8VBT6 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ApobrQ8VBT6 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ApobrQ8VBT6 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ApobrQ8VBT6 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ApobrQ8VBT6 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ApobrQ8VBT6 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ApobrQ8VBT6 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ApobrQ8VBT6 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ApobrQ8VBT6 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ApobrQ8VBT6 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ApobrQ8VBT6 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ApobrQ8VBT6 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ApobrQ8VBT6 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ApobrQ8VBT6 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ApobrQ8VBT6 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ApobrQ8VBT6 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ApobrQ8VBT6 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
ApobrQ8VBT6 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ApobrQ8VBT6 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
ApobrQ8VBT6 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ApobrQ8VBT6 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ApobrQ8VBT6 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ApobrQ8VBT6 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ApobrQ8VBT6 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ApobrQ8VBT6 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ApobrQ8VBT6 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ApobrQ8VBT6 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ApobrQ8VBT6 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ApobrQ8VBT6 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ApobrQ8VBT6 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
ApobrQ8VBT6 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ApobrQ8VBT6 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ApobrQ8VBT6 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ApobrQ8VBT6 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ApobrQ8VBT6 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ApobrQ8VBT6 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ApobrQ8VBT6 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ApobrQ8VBT6 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ApobrQ8VBT6 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ApobrQ8VBT6 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ApobrQ8VBT6 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ApobrQ8VBT6 1810026B05Rik-205ENSMUST00000184855 409 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ApobrQ8VBT6 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
ApobrQ8VBT6 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ApobrQ8VBT6 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ApobrQ8VBT6 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ApobrQ8VBT6 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ApobrQ8VBT6 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21 ms