Protein–RNA interactions for Protein: Q8R0F6

Ilkap, Integrin-linked kinase-associated serine/threonine phosphatase 2C, mousemouse

Predictions only

Length 392 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IlkapQ8R0F6 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
IlkapQ8R0F6 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
IlkapQ8R0F6 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
IlkapQ8R0F6 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
IlkapQ8R0F6 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
IlkapQ8R0F6 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
IlkapQ8R0F6 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
IlkapQ8R0F6 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
IlkapQ8R0F6 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
IlkapQ8R0F6 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
IlkapQ8R0F6 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
IlkapQ8R0F6 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
IlkapQ8R0F6 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
IlkapQ8R0F6 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC17.33■□□□□ 0.37
IlkapQ8R0F6 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
IlkapQ8R0F6 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
IlkapQ8R0F6 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
IlkapQ8R0F6 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
IlkapQ8R0F6 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
IlkapQ8R0F6 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
IlkapQ8R0F6 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
IlkapQ8R0F6 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
IlkapQ8R0F6 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
IlkapQ8R0F6 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
IlkapQ8R0F6 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
IlkapQ8R0F6 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
IlkapQ8R0F6 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
IlkapQ8R0F6 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
IlkapQ8R0F6 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
IlkapQ8R0F6 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
IlkapQ8R0F6 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
IlkapQ8R0F6 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
IlkapQ8R0F6 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
IlkapQ8R0F6 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
IlkapQ8R0F6 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
IlkapQ8R0F6 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
IlkapQ8R0F6 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
IlkapQ8R0F6 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
IlkapQ8R0F6 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
IlkapQ8R0F6 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
IlkapQ8R0F6 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
IlkapQ8R0F6 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
IlkapQ8R0F6 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
IlkapQ8R0F6 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
IlkapQ8R0F6 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
IlkapQ8R0F6 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
IlkapQ8R0F6 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
IlkapQ8R0F6 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
IlkapQ8R0F6 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
IlkapQ8R0F6 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
IlkapQ8R0F6 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
IlkapQ8R0F6 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
IlkapQ8R0F6 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
IlkapQ8R0F6 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
IlkapQ8R0F6 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
IlkapQ8R0F6 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
IlkapQ8R0F6 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
IlkapQ8R0F6 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
IlkapQ8R0F6 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
IlkapQ8R0F6 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
IlkapQ8R0F6 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
IlkapQ8R0F6 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
IlkapQ8R0F6 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
IlkapQ8R0F6 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
IlkapQ8R0F6 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
IlkapQ8R0F6 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
IlkapQ8R0F6 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
IlkapQ8R0F6 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
IlkapQ8R0F6 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
IlkapQ8R0F6 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
IlkapQ8R0F6 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
IlkapQ8R0F6 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
IlkapQ8R0F6 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
IlkapQ8R0F6 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
IlkapQ8R0F6 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
IlkapQ8R0F6 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
IlkapQ8R0F6 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
IlkapQ8R0F6 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
IlkapQ8R0F6 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
IlkapQ8R0F6 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
IlkapQ8R0F6 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
IlkapQ8R0F6 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
IlkapQ8R0F6 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
IlkapQ8R0F6 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
IlkapQ8R0F6 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
IlkapQ8R0F6 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
IlkapQ8R0F6 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
IlkapQ8R0F6 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
IlkapQ8R0F6 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
IlkapQ8R0F6 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
IlkapQ8R0F6 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
IlkapQ8R0F6 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
IlkapQ8R0F6 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
IlkapQ8R0F6 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
IlkapQ8R0F6 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
IlkapQ8R0F6 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
IlkapQ8R0F6 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
IlkapQ8R0F6 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
IlkapQ8R0F6 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
IlkapQ8R0F6 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.4 ms