Protein–RNA interactions for Protein: Q8K377

Lrrtm1, Leucine-rich repeat transmembrane neuronal protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 522 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrtm1Q8K377 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Lrrtm1Q8K377 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Lrrtm1Q8K377 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Lrrtm1Q8K377 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Lrrtm1Q8K377 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Lrrtm1Q8K377 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Lrrtm1Q8K377 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Lrrtm1Q8K377 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Lrrtm1Q8K377 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Lrrtm1Q8K377 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Lrrtm1Q8K377 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Lrrtm1Q8K377 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Lrrtm1Q8K377 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Lrrtm1Q8K377 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Lrrtm1Q8K377 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Lrrtm1Q8K377 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Lrrtm1Q8K377 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Lrrtm1Q8K377 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Lrrtm1Q8K377 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Lrrtm1Q8K377 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Lrrtm1Q8K377 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Lrrtm1Q8K377 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lrrtm1Q8K377 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lrrtm1Q8K377 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lrrtm1Q8K377 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lrrtm1Q8K377 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lrrtm1Q8K377 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lrrtm1Q8K377 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lrrtm1Q8K377 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lrrtm1Q8K377 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lrrtm1Q8K377 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lrrtm1Q8K377 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lrrtm1Q8K377 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lrrtm1Q8K377 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lrrtm1Q8K377 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lrrtm1Q8K377 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lrrtm1Q8K377 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lrrtm1Q8K377 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lrrtm1Q8K377 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Lrrtm1Q8K377 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lrrtm1Q8K377 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lrrtm1Q8K377 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lrrtm1Q8K377 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lrrtm1Q8K377 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lrrtm1Q8K377 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Lrrtm1Q8K377 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lrrtm1Q8K377 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lrrtm1Q8K377 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Lrrtm1Q8K377 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lrrtm1Q8K377 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lrrtm1Q8K377 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lrrtm1Q8K377 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lrrtm1Q8K377 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lrrtm1Q8K377 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lrrtm1Q8K377 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lrrtm1Q8K377 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lrrtm1Q8K377 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lrrtm1Q8K377 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lrrtm1Q8K377 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lrrtm1Q8K377 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lrrtm1Q8K377 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lrrtm1Q8K377 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lrrtm1Q8K377 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lrrtm1Q8K377 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lrrtm1Q8K377 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lrrtm1Q8K377 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lrrtm1Q8K377 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lrrtm1Q8K377 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lrrtm1Q8K377 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lrrtm1Q8K377 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lrrtm1Q8K377 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lrrtm1Q8K377 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Lrrtm1Q8K377 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lrrtm1Q8K377 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Lrrtm1Q8K377 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lrrtm1Q8K377 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lrrtm1Q8K377 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lrrtm1Q8K377 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lrrtm1Q8K377 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lrrtm1Q8K377 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lrrtm1Q8K377 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lrrtm1Q8K377 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lrrtm1Q8K377 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lrrtm1Q8K377 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lrrtm1Q8K377 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lrrtm1Q8K377 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lrrtm1Q8K377 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lrrtm1Q8K377 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lrrtm1Q8K377 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Lrrtm1Q8K377 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Lrrtm1Q8K377 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Lrrtm1Q8K377 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Lrrtm1Q8K377 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Lrrtm1Q8K377 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Lrrtm1Q8K377 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Lrrtm1Q8K377 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Lrrtm1Q8K377 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Lrrtm1Q8K377 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Lrrtm1Q8K377 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Lrrtm1Q8K377 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.3 ms