Protein–RNA interactions for Protein: Q8K1E6

Alkbh3, Alpha-ketoglutarate-dependent dioxygenase alkB homolog 3, mousemouse

Predictions only

Length 286 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Alkbh3Q8K1E6 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Alkbh3Q8K1E6 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Alkbh3Q8K1E6 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Alkbh3Q8K1E6 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Alkbh3Q8K1E6 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Alkbh3Q8K1E6 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Alkbh3Q8K1E6 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Alkbh3Q8K1E6 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Alkbh3Q8K1E6 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Alkbh3Q8K1E6 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Alkbh3Q8K1E6 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Alkbh3Q8K1E6 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Alkbh3Q8K1E6 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Alkbh3Q8K1E6 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Alkbh3Q8K1E6 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Alkbh3Q8K1E6 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Alkbh3Q8K1E6 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Alkbh3Q8K1E6 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Alkbh3Q8K1E6 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Alkbh3Q8K1E6 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Alkbh3Q8K1E6 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Alkbh3Q8K1E6 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Alkbh3Q8K1E6 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Alkbh3Q8K1E6 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Alkbh3Q8K1E6 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Alkbh3Q8K1E6 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Alkbh3Q8K1E6 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Alkbh3Q8K1E6 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Alkbh3Q8K1E6 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Alkbh3Q8K1E6 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Alkbh3Q8K1E6 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Alkbh3Q8K1E6 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Alkbh3Q8K1E6 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Alkbh3Q8K1E6 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Alkbh3Q8K1E6 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Alkbh3Q8K1E6 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Alkbh3Q8K1E6 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Alkbh3Q8K1E6 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Alkbh3Q8K1E6 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Alkbh3Q8K1E6 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Alkbh3Q8K1E6 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Alkbh3Q8K1E6 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Alkbh3Q8K1E6 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Alkbh3Q8K1E6 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Alkbh3Q8K1E6 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Alkbh3Q8K1E6 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Alkbh3Q8K1E6 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Alkbh3Q8K1E6 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Alkbh3Q8K1E6 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Alkbh3Q8K1E6 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Alkbh3Q8K1E6 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Alkbh3Q8K1E6 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Alkbh3Q8K1E6 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Alkbh3Q8K1E6 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Alkbh3Q8K1E6 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Alkbh3Q8K1E6 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Alkbh3Q8K1E6 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Alkbh3Q8K1E6 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Alkbh3Q8K1E6 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Alkbh3Q8K1E6 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Alkbh3Q8K1E6 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Alkbh3Q8K1E6 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Alkbh3Q8K1E6 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Alkbh3Q8K1E6 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Alkbh3Q8K1E6 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Alkbh3Q8K1E6 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Alkbh3Q8K1E6 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Alkbh3Q8K1E6 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Alkbh3Q8K1E6 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Alkbh3Q8K1E6 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Alkbh3Q8K1E6 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Alkbh3Q8K1E6 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Alkbh3Q8K1E6 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Alkbh3Q8K1E6 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Alkbh3Q8K1E6 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Alkbh3Q8K1E6 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Alkbh3Q8K1E6 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Alkbh3Q8K1E6 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Alkbh3Q8K1E6 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Alkbh3Q8K1E6 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Alkbh3Q8K1E6 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Alkbh3Q8K1E6 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Alkbh3Q8K1E6 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Alkbh3Q8K1E6 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Alkbh3Q8K1E6 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Alkbh3Q8K1E6 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Alkbh3Q8K1E6 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Alkbh3Q8K1E6 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Alkbh3Q8K1E6 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Alkbh3Q8K1E6 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Alkbh3Q8K1E6 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Alkbh3Q8K1E6 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Alkbh3Q8K1E6 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Alkbh3Q8K1E6 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Alkbh3Q8K1E6 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Alkbh3Q8K1E6 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Alkbh3Q8K1E6 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Alkbh3Q8K1E6 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Alkbh3Q8K1E6 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Alkbh3Q8K1E6 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.4 ms