Protein–RNA interactions for Protein: Q8K199

Cmc2, COX assembly mitochondrial protein 2 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 79 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cmc2Q8K199 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cmc2Q8K199 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cmc2Q8K199 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cmc2Q8K199 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cmc2Q8K199 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cmc2Q8K199 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cmc2Q8K199 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cmc2Q8K199 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cmc2Q8K199 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cmc2Q8K199 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Cmc2Q8K199 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Cmc2Q8K199 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Cmc2Q8K199 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cmc2Q8K199 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cmc2Q8K199 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cmc2Q8K199 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cmc2Q8K199 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cmc2Q8K199 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Cmc2Q8K199 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Cmc2Q8K199 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Cmc2Q8K199 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Cmc2Q8K199 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cmc2Q8K199 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Cmc2Q8K199 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cmc2Q8K199 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cmc2Q8K199 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cmc2Q8K199 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Cmc2Q8K199 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cmc2Q8K199 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Cmc2Q8K199 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cmc2Q8K199 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Cmc2Q8K199 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cmc2Q8K199 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Cmc2Q8K199 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cmc2Q8K199 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Cmc2Q8K199 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cmc2Q8K199 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cmc2Q8K199 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Cmc2Q8K199 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Cmc2Q8K199 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Cmc2Q8K199 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Cmc2Q8K199 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Cmc2Q8K199 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Cmc2Q8K199 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cmc2Q8K199 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cmc2Q8K199 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cmc2Q8K199 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cmc2Q8K199 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Cmc2Q8K199 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cmc2Q8K199 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cmc2Q8K199 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cmc2Q8K199 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Cmc2Q8K199 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cmc2Q8K199 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cmc2Q8K199 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cmc2Q8K199 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cmc2Q8K199 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cmc2Q8K199 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Cmc2Q8K199 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cmc2Q8K199 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cmc2Q8K199 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cmc2Q8K199 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Cmc2Q8K199 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Cmc2Q8K199 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cmc2Q8K199 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Cmc2Q8K199 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cmc2Q8K199 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cmc2Q8K199 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cmc2Q8K199 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cmc2Q8K199 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cmc2Q8K199 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cmc2Q8K199 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cmc2Q8K199 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Cmc2Q8K199 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Cmc2Q8K199 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Cmc2Q8K199 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Cmc2Q8K199 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Cmc2Q8K199 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Cmc2Q8K199 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Cmc2Q8K199 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Cmc2Q8K199 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Cmc2Q8K199 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cmc2Q8K199 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Cmc2Q8K199 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Cmc2Q8K199 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cmc2Q8K199 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Cmc2Q8K199 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Cmc2Q8K199 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cmc2Q8K199 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cmc2Q8K199 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cmc2Q8K199 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cmc2Q8K199 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cmc2Q8K199 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cmc2Q8K199 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cmc2Q8K199 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cmc2Q8K199 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cmc2Q8K199 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cmc2Q8K199 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cmc2Q8K199 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cmc2Q8K199 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.4 ms