Protein–RNA interactions for Protein: Q8K193

Cldn34c1, Claudin 34C1, mousemouse

Predictions only

Length 234 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn34c1Q8K193 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Cldn34c1Q8K193 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Cldn34c1Q8K193 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Cldn34c1Q8K193 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Cldn34c1Q8K193 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Cldn34c1Q8K193 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Cldn34c1Q8K193 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Cldn34c1Q8K193 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Cldn34c1Q8K193 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Cldn34c1Q8K193 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Cldn34c1Q8K193 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Cldn34c1Q8K193 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Cldn34c1Q8K193 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Cldn34c1Q8K193 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Cldn34c1Q8K193 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Cldn34c1Q8K193 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Cldn34c1Q8K193 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Cldn34c1Q8K193 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Cldn34c1Q8K193 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Cldn34c1Q8K193 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Cldn34c1Q8K193 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Cldn34c1Q8K193 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Cldn34c1Q8K193 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Cldn34c1Q8K193 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Cldn34c1Q8K193 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Cldn34c1Q8K193 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Cldn34c1Q8K193 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Cldn34c1Q8K193 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Cldn34c1Q8K193 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Cldn34c1Q8K193 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Cldn34c1Q8K193 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Cldn34c1Q8K193 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Cldn34c1Q8K193 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Cldn34c1Q8K193 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC14.46□□□□□ -0.1
Cldn34c1Q8K193 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Cldn34c1Q8K193 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Cldn34c1Q8K193 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Cldn34c1Q8K193 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Cldn34c1Q8K193 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Cldn34c1Q8K193 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Cldn34c1Q8K193 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Cldn34c1Q8K193 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC14.45□□□□□ -0.1
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Cldn34c1Q8K193 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Cldn34c1Q8K193 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Cldn34c1Q8K193 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Cldn34c1Q8K193 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Cldn34c1Q8K193 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Cldn34c1Q8K193 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Cldn34c1Q8K193 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Cldn34c1Q8K193 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Cldn34c1Q8K193 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Cldn34c1Q8K193 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Cldn34c1Q8K193 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Cldn34c1Q8K193 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Cldn34c1Q8K193 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Cldn34c1Q8K193 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC14.44□□□□□ -0.1
Cldn34c1Q8K193 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Cldn34c1Q8K193 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Cldn34c1Q8K193 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.44□□□□□ -0.1
Cldn34c1Q8K193 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Cldn34c1Q8K193 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Cldn34c1Q8K193 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.44□□□□□ -0.1
Cldn34c1Q8K193 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
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Cldn34c1Q8K193 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC14.44□□□□□ -0.1
Cldn34c1Q8K193 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Cldn34c1Q8K193 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Cldn34c1Q8K193 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Cldn34c1Q8K193 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.44□□□□□ -0.1
Cldn34c1Q8K193 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Cldn34c1Q8K193 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC14.44□□□□□ -0.1
Cldn34c1Q8K193 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Cldn34c1Q8K193 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Cldn34c1Q8K193 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC14.44□□□□□ -0.1
Cldn34c1Q8K193 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Cldn34c1Q8K193 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
Cldn34c1Q8K193 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
Cldn34c1Q8K193 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
Cldn34c1Q8K193 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
Cldn34c1Q8K193 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
Cldn34c1Q8K193 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
Cldn34c1Q8K193 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
Cldn34c1Q8K193 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.43□□□□□ -0.1
Cldn34c1Q8K193 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
Cldn34c1Q8K193 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC14.43□□□□□ -0.1
Cldn34c1Q8K193 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
Cldn34c1Q8K193 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.43□□□□□ -0.1
Cldn34c1Q8K193 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
Cldn34c1Q8K193 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
Cldn34c1Q8K193 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
Cldn34c1Q8K193 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC14.43□□□□□ -0.1
Cldn34c1Q8K193 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
Cldn34c1Q8K193 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
Cldn34c1Q8K193 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.43□□□□□ -0.1
Cldn34c1Q8K193 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
Cldn34c1Q8K193 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.43□□□□□ -0.1
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Cldn34c1Q8K193 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
Cldn34c1Q8K193 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
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