Protein–RNA interactions for Protein: Q8CFD5

Ercc8, DNA excision repair protein ERCC-8, mousemouse

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Length 397 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ercc8Q8CFD5 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ercc8Q8CFD5 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ercc8Q8CFD5 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ercc8Q8CFD5 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ercc8Q8CFD5 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Ercc8Q8CFD5 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Ercc8Q8CFD5 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Ercc8Q8CFD5 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Ercc8Q8CFD5 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Ercc8Q8CFD5 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Ercc8Q8CFD5 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Ercc8Q8CFD5 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC14.52□□□□□ -0.08
Ercc8Q8CFD5 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Ercc8Q8CFD5 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ercc8Q8CFD5 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ercc8Q8CFD5 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ercc8Q8CFD5 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ercc8Q8CFD5 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ercc8Q8CFD5 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ercc8Q8CFD5 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ercc8Q8CFD5 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ercc8Q8CFD5 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ercc8Q8CFD5 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ercc8Q8CFD5 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ercc8Q8CFD5 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ercc8Q8CFD5 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ercc8Q8CFD5 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ercc8Q8CFD5 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ercc8Q8CFD5 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ercc8Q8CFD5 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ercc8Q8CFD5 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ercc8Q8CFD5 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ercc8Q8CFD5 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ercc8Q8CFD5 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ercc8Q8CFD5 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ercc8Q8CFD5 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ercc8Q8CFD5 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ercc8Q8CFD5 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ercc8Q8CFD5 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Ercc8Q8CFD5 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
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Ercc8Q8CFD5 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ercc8Q8CFD5 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
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Ercc8Q8CFD5 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
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Ercc8Q8CFD5 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ercc8Q8CFD5 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ercc8Q8CFD5 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ercc8Q8CFD5 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ercc8Q8CFD5 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ercc8Q8CFD5 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ercc8Q8CFD5 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
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Ercc8Q8CFD5 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ercc8Q8CFD5 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ercc8Q8CFD5 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
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Ercc8Q8CFD5 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ercc8Q8CFD5 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ercc8Q8CFD5 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ercc8Q8CFD5 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ercc8Q8CFD5 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
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Ercc8Q8CFD5 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ercc8Q8CFD5 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ercc8Q8CFD5 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ercc8Q8CFD5 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ercc8Q8CFD5 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ercc8Q8CFD5 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ercc8Q8CFD5 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ercc8Q8CFD5 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ercc8Q8CFD5 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ercc8Q8CFD5 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ercc8Q8CFD5 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ercc8Q8CFD5 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ercc8Q8CFD5 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ercc8Q8CFD5 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ercc8Q8CFD5 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ercc8Q8CFD5 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ercc8Q8CFD5 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ercc8Q8CFD5 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ercc8Q8CFD5 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ercc8Q8CFD5 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ercc8Q8CFD5 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ercc8Q8CFD5 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ercc8Q8CFD5 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ercc8Q8CFD5 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ercc8Q8CFD5 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
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