Protein–RNA interactions for Protein: Q8CEG8

Usp27, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 27, mousemouse

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Length 438 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp27Q8CEG8 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Usp27Q8CEG8 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Usp27Q8CEG8 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Usp27Q8CEG8 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Usp27Q8CEG8 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Usp27Q8CEG8 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Usp27Q8CEG8 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Usp27Q8CEG8 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Usp27Q8CEG8 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
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Usp27Q8CEG8 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
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Usp27Q8CEG8 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Usp27Q8CEG8 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Usp27Q8CEG8 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Usp27Q8CEG8 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
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Usp27Q8CEG8 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
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Usp27Q8CEG8 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
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Usp27Q8CEG8 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Usp27Q8CEG8 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
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Usp27Q8CEG8 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Usp27Q8CEG8 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Usp27Q8CEG8 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Usp27Q8CEG8 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Usp27Q8CEG8 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Usp27Q8CEG8 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
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Usp27Q8CEG8 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
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