Protein–RNA interactions for Protein: Q8CAI1

Ccdc142, Coiled-coil domain-containing protein 142, mousemouse

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Length 738 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc142Q8CAI1 Trappc6a-202ENSMUST00000108455 651 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ccdc142Q8CAI1 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ccdc142Q8CAI1 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ccdc142Q8CAI1 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ccdc142Q8CAI1 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ccdc142Q8CAI1 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ccdc142Q8CAI1 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ccdc142Q8CAI1 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ccdc142Q8CAI1 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ccdc142Q8CAI1 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ccdc142Q8CAI1 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ccdc142Q8CAI1 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Ccdc142Q8CAI1 Gm18206-201ENSMUST00000207027 926 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Ccdc142Q8CAI1 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Ccdc142Q8CAI1 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ccdc142Q8CAI1 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ccdc142Q8CAI1 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ccdc142Q8CAI1 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ccdc142Q8CAI1 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ccdc142Q8CAI1 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ccdc142Q8CAI1 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ccdc142Q8CAI1 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ccdc142Q8CAI1 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ccdc142Q8CAI1 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ccdc142Q8CAI1 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ccdc142Q8CAI1 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ccdc142Q8CAI1 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ccdc142Q8CAI1 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ccdc142Q8CAI1 Gm11906-201ENSMUST00000124792 680 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ccdc142Q8CAI1 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Ccdc142Q8CAI1 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ccdc142Q8CAI1 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ccdc142Q8CAI1 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ccdc142Q8CAI1 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ccdc142Q8CAI1 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ccdc142Q8CAI1 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ccdc142Q8CAI1 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ccdc142Q8CAI1 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ccdc142Q8CAI1 Enkd1-201ENSMUST00000013299 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ccdc142Q8CAI1 Gm15492-201ENSMUST00000156734 606 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ccdc142Q8CAI1 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Ccdc142Q8CAI1 AC148328.1-201ENSMUST00000216448 920 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ccdc142Q8CAI1 Hist1h4j-201ENSMUST00000087714 774 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ccdc142Q8CAI1 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ccdc142Q8CAI1 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ccdc142Q8CAI1 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ccdc142Q8CAI1 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Ccdc142Q8CAI1 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.82
Ccdc142Q8CAI1 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ccdc142Q8CAI1 Gm21586-201ENSMUST00000107988 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ccdc142Q8CAI1 Gm21953-201ENSMUST00000108002 264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ccdc142Q8CAI1 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ccdc142Q8CAI1 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ccdc142Q8CAI1 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ccdc142Q8CAI1 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ccdc142Q8CAI1 Gm20878-208ENSMUST00000181518 264 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ccdc142Q8CAI1 Gm18195-201ENSMUST00000207604 706 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Ccdc142Q8CAI1 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ccdc142Q8CAI1 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ccdc142Q8CAI1 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ccdc142Q8CAI1 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ccdc142Q8CAI1 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ccdc142Q8CAI1 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ccdc142Q8CAI1 Gm11611-201ENSMUST00000134289 1326 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ccdc142Q8CAI1 Mpc1-205ENSMUST00000142594 961 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ccdc142Q8CAI1 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Ccdc142Q8CAI1 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Ccdc142Q8CAI1 Tssc4-208ENSMUST00000208779 647 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ccdc142Q8CAI1 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Ccdc142Q8CAI1 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ccdc142Q8CAI1 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ccdc142Q8CAI1 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ccdc142Q8CAI1 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ccdc142Q8CAI1 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ccdc142Q8CAI1 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ccdc142Q8CAI1 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ccdc142Q8CAI1 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ccdc142Q8CAI1 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ccdc142Q8CAI1 Prss45-202ENSMUST00000146794 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ccdc142Q8CAI1 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ccdc142Q8CAI1 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ccdc142Q8CAI1 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ccdc142Q8CAI1 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ccdc142Q8CAI1 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ccdc142Q8CAI1 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ccdc142Q8CAI1 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ccdc142Q8CAI1 Gm15677-201ENSMUST00000152302 766 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ccdc142Q8CAI1 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Ccdc142Q8CAI1 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ccdc142Q8CAI1 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ccdc142Q8CAI1 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ccdc142Q8CAI1 Gm11452-201ENSMUST00000122376 690 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Ccdc142Q8CAI1 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ccdc142Q8CAI1 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ccdc142Q8CAI1 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ccdc142Q8CAI1 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ccdc142Q8CAI1 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ccdc142Q8CAI1 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ccdc142Q8CAI1 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ccdc142Q8CAI1 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
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