Protein–RNA interactions for Protein: Q8BXF8

Actrt3, Actin-related protein T3, mousemouse

Predictions only

Length 369 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Actrt3Q8BXF8 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Actrt3Q8BXF8 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Actrt3Q8BXF8 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Actrt3Q8BXF8 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Actrt3Q8BXF8 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Actrt3Q8BXF8 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Actrt3Q8BXF8 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Actrt3Q8BXF8 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Actrt3Q8BXF8 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Actrt3Q8BXF8 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Actrt3Q8BXF8 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Actrt3Q8BXF8 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Actrt3Q8BXF8 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Actrt3Q8BXF8 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Actrt3Q8BXF8 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Actrt3Q8BXF8 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Actrt3Q8BXF8 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Actrt3Q8BXF8 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Actrt3Q8BXF8 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Actrt3Q8BXF8 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Actrt3Q8BXF8 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Actrt3Q8BXF8 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Actrt3Q8BXF8 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Actrt3Q8BXF8 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Actrt3Q8BXF8 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Actrt3Q8BXF8 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Actrt3Q8BXF8 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Actrt3Q8BXF8 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Actrt3Q8BXF8 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Actrt3Q8BXF8 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Actrt3Q8BXF8 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Actrt3Q8BXF8 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Actrt3Q8BXF8 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Actrt3Q8BXF8 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Actrt3Q8BXF8 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Actrt3Q8BXF8 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Actrt3Q8BXF8 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Actrt3Q8BXF8 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Actrt3Q8BXF8 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Actrt3Q8BXF8 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Actrt3Q8BXF8 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Actrt3Q8BXF8 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Actrt3Q8BXF8 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Actrt3Q8BXF8 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Actrt3Q8BXF8 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Actrt3Q8BXF8 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Actrt3Q8BXF8 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Actrt3Q8BXF8 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Actrt3Q8BXF8 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Actrt3Q8BXF8 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Actrt3Q8BXF8 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Actrt3Q8BXF8 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Actrt3Q8BXF8 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Actrt3Q8BXF8 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Actrt3Q8BXF8 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Actrt3Q8BXF8 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Actrt3Q8BXF8 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Actrt3Q8BXF8 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Actrt3Q8BXF8 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Actrt3Q8BXF8 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Actrt3Q8BXF8 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Actrt3Q8BXF8 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Actrt3Q8BXF8 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Actrt3Q8BXF8 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Actrt3Q8BXF8 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Actrt3Q8BXF8 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Actrt3Q8BXF8 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Actrt3Q8BXF8 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Actrt3Q8BXF8 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Actrt3Q8BXF8 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Actrt3Q8BXF8 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Actrt3Q8BXF8 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Actrt3Q8BXF8 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Actrt3Q8BXF8 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Actrt3Q8BXF8 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Actrt3Q8BXF8 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Actrt3Q8BXF8 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Actrt3Q8BXF8 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Actrt3Q8BXF8 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Actrt3Q8BXF8 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Actrt3Q8BXF8 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Actrt3Q8BXF8 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Actrt3Q8BXF8 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Actrt3Q8BXF8 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Actrt3Q8BXF8 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Actrt3Q8BXF8 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Actrt3Q8BXF8 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Actrt3Q8BXF8 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Actrt3Q8BXF8 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Actrt3Q8BXF8 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Actrt3Q8BXF8 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Actrt3Q8BXF8 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Actrt3Q8BXF8 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Actrt3Q8BXF8 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Actrt3Q8BXF8 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Actrt3Q8BXF8 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Actrt3Q8BXF8 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Actrt3Q8BXF8 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Actrt3Q8BXF8 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Actrt3Q8BXF8 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.5 ms