Protein–RNA interactions for Protein: Q8BUY9

Pggt1b, Geranylgeranyl transferase type-1 subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 377 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pggt1bQ8BUY9 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Pggt1bQ8BUY9 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Pggt1bQ8BUY9 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Pggt1bQ8BUY9 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Pggt1bQ8BUY9 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Pggt1bQ8BUY9 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Pggt1bQ8BUY9 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Pggt1bQ8BUY9 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Pggt1bQ8BUY9 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Pggt1bQ8BUY9 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Pggt1bQ8BUY9 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Pggt1bQ8BUY9 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Pggt1bQ8BUY9 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Pggt1bQ8BUY9 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Pggt1bQ8BUY9 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Pggt1bQ8BUY9 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Pggt1bQ8BUY9 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Pggt1bQ8BUY9 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Pggt1bQ8BUY9 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Pggt1bQ8BUY9 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Pggt1bQ8BUY9 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Pggt1bQ8BUY9 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Pggt1bQ8BUY9 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Pggt1bQ8BUY9 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Pggt1bQ8BUY9 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Pggt1bQ8BUY9 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Pggt1bQ8BUY9 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Pggt1bQ8BUY9 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Pggt1bQ8BUY9 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Pggt1bQ8BUY9 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Pggt1bQ8BUY9 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Pggt1bQ8BUY9 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Pggt1bQ8BUY9 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Pggt1bQ8BUY9 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Pggt1bQ8BUY9 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Pggt1bQ8BUY9 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Pggt1bQ8BUY9 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Pggt1bQ8BUY9 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Pggt1bQ8BUY9 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Pggt1bQ8BUY9 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Pggt1bQ8BUY9 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Pggt1bQ8BUY9 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Pggt1bQ8BUY9 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Pggt1bQ8BUY9 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Pggt1bQ8BUY9 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Pggt1bQ8BUY9 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Pggt1bQ8BUY9 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Pggt1bQ8BUY9 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Pggt1bQ8BUY9 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Pggt1bQ8BUY9 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Pggt1bQ8BUY9 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Pggt1bQ8BUY9 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Pggt1bQ8BUY9 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Pggt1bQ8BUY9 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Pggt1bQ8BUY9 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Pggt1bQ8BUY9 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Pggt1bQ8BUY9 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Pggt1bQ8BUY9 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Pggt1bQ8BUY9 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Pggt1bQ8BUY9 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Pggt1bQ8BUY9 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Pggt1bQ8BUY9 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Pggt1bQ8BUY9 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Pggt1bQ8BUY9 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Pggt1bQ8BUY9 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Pggt1bQ8BUY9 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Pggt1bQ8BUY9 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Pggt1bQ8BUY9 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
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Pggt1bQ8BUY9 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Pggt1bQ8BUY9 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Pggt1bQ8BUY9 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Pggt1bQ8BUY9 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Pggt1bQ8BUY9 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Pggt1bQ8BUY9 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Pggt1bQ8BUY9 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Pggt1bQ8BUY9 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Pggt1bQ8BUY9 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Pggt1bQ8BUY9 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Pggt1bQ8BUY9 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Pggt1bQ8BUY9 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Pggt1bQ8BUY9 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Pggt1bQ8BUY9 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Pggt1bQ8BUY9 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Pggt1bQ8BUY9 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Pggt1bQ8BUY9 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Pggt1bQ8BUY9 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Pggt1bQ8BUY9 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Pggt1bQ8BUY9 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Pggt1bQ8BUY9 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Pggt1bQ8BUY9 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Pggt1bQ8BUY9 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Pggt1bQ8BUY9 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
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Pggt1bQ8BUY9 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Pggt1bQ8BUY9 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Pggt1bQ8BUY9 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Pggt1bQ8BUY9 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Pggt1bQ8BUY9 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.7 ms