Protein–RNA interactions for Protein: Q8BTU7

Rccd1, RCC1 domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 377 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rccd1Q8BTU7 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rccd1Q8BTU7 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rccd1Q8BTU7 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rccd1Q8BTU7 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rccd1Q8BTU7 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rccd1Q8BTU7 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rccd1Q8BTU7 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rccd1Q8BTU7 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rccd1Q8BTU7 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rccd1Q8BTU7 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rccd1Q8BTU7 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rccd1Q8BTU7 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rccd1Q8BTU7 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rccd1Q8BTU7 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rccd1Q8BTU7 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rccd1Q8BTU7 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rccd1Q8BTU7 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rccd1Q8BTU7 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rccd1Q8BTU7 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rccd1Q8BTU7 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rccd1Q8BTU7 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rccd1Q8BTU7 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rccd1Q8BTU7 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rccd1Q8BTU7 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rccd1Q8BTU7 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rccd1Q8BTU7 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rccd1Q8BTU7 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rccd1Q8BTU7 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rccd1Q8BTU7 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rccd1Q8BTU7 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rccd1Q8BTU7 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rccd1Q8BTU7 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rccd1Q8BTU7 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rccd1Q8BTU7 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rccd1Q8BTU7 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rccd1Q8BTU7 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rccd1Q8BTU7 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rccd1Q8BTU7 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rccd1Q8BTU7 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rccd1Q8BTU7 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rccd1Q8BTU7 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rccd1Q8BTU7 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rccd1Q8BTU7 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rccd1Q8BTU7 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rccd1Q8BTU7 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rccd1Q8BTU7 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rccd1Q8BTU7 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rccd1Q8BTU7 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rccd1Q8BTU7 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rccd1Q8BTU7 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rccd1Q8BTU7 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rccd1Q8BTU7 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rccd1Q8BTU7 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rccd1Q8BTU7 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rccd1Q8BTU7 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rccd1Q8BTU7 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rccd1Q8BTU7 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rccd1Q8BTU7 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rccd1Q8BTU7 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rccd1Q8BTU7 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rccd1Q8BTU7 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rccd1Q8BTU7 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rccd1Q8BTU7 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rccd1Q8BTU7 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rccd1Q8BTU7 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rccd1Q8BTU7 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rccd1Q8BTU7 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rccd1Q8BTU7 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rccd1Q8BTU7 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rccd1Q8BTU7 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rccd1Q8BTU7 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Rccd1Q8BTU7 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rccd1Q8BTU7 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rccd1Q8BTU7 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rccd1Q8BTU7 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rccd1Q8BTU7 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rccd1Q8BTU7 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Rccd1Q8BTU7 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rccd1Q8BTU7 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rccd1Q8BTU7 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rccd1Q8BTU7 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rccd1Q8BTU7 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rccd1Q8BTU7 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rccd1Q8BTU7 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rccd1Q8BTU7 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
Rccd1Q8BTU7 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
Rccd1Q8BTU7 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.5
Rccd1Q8BTU7 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rccd1Q8BTU7 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rccd1Q8BTU7 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rccd1Q8BTU7 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rccd1Q8BTU7 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Rccd1Q8BTU7 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rccd1Q8BTU7 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rccd1Q8BTU7 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rccd1Q8BTU7 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rccd1Q8BTU7 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rccd1Q8BTU7 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rccd1Q8BTU7 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rccd1Q8BTU7 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 100.7 ms