Protein–RNA interactions for Protein: Q8BQ08

5730596B20Rik, RIKEN cDNA 5730596B20 gene, mousemouse

Predictions only

Length 205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
5730596B20RikQ8BQ08 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
5730596B20RikQ8BQ08 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
5730596B20RikQ8BQ08 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
5730596B20RikQ8BQ08 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
5730596B20RikQ8BQ08 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
5730596B20RikQ8BQ08 Gm37660-201ENSMUST00000192754 1732 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
5730596B20RikQ8BQ08 Gm37785-201ENSMUST00000195783 2408 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
5730596B20RikQ8BQ08 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
5730596B20RikQ8BQ08 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
5730596B20RikQ8BQ08 Gm16617-201ENSMUST00000181008 675 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
5730596B20RikQ8BQ08 Gm27216-202ENSMUST00000184100 635 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
5730596B20RikQ8BQ08 Gm37215-201ENSMUST00000194927 1259 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
5730596B20RikQ8BQ08 AC153529.1-201ENSMUST00000217818 370 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
5730596B20RikQ8BQ08 CT030194.1-201ENSMUST00000225507 532 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
5730596B20RikQ8BQ08 AC165260.4-201ENSMUST00000225924 724 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
5730596B20RikQ8BQ08 Acbd7-202ENSMUST00000228935 534 ntAPPRIS ALT1 BASIC12.35□□□□□ -0.43
5730596B20RikQ8BQ08 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
5730596B20RikQ8BQ08 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
5730596B20RikQ8BQ08 Olfr619-201ENSMUST00000098196 1124 ntAPPRIS P1 BASIC12.35□□□□□ -0.43
5730596B20RikQ8BQ08 Olfr995-201ENSMUST00000099924 1113 ntAPPRIS P1 BASIC12.35□□□□□ -0.43
5730596B20RikQ8BQ08 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
5730596B20RikQ8BQ08 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
5730596B20RikQ8BQ08 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
5730596B20RikQ8BQ08 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
5730596B20RikQ8BQ08 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
5730596B20RikQ8BQ08 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
5730596B20RikQ8BQ08 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
5730596B20RikQ8BQ08 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
5730596B20RikQ8BQ08 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
5730596B20RikQ8BQ08 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
5730596B20RikQ8BQ08 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
5730596B20RikQ8BQ08 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
5730596B20RikQ8BQ08 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
5730596B20RikQ8BQ08 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
5730596B20RikQ8BQ08 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
5730596B20RikQ8BQ08 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
5730596B20RikQ8BQ08 Gm15640-201ENSMUST00000152070 527 ntTSL 2 BASIC12.34□□□□□ -0.43
5730596B20RikQ8BQ08 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
5730596B20RikQ8BQ08 Gm21190-202ENSMUST00000196384 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
5730596B20RikQ8BQ08 Gm43787-201ENSMUST00000197792 1037 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
5730596B20RikQ8BQ08 Gm21149-201ENSMUST00000197995 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
5730596B20RikQ8BQ08 4930449E01Rik-201ENSMUST00000022711 595 ntTSL 2 BASIC12.34□□□□□ -0.43
5730596B20RikQ8BQ08 Patz1-207ENSMUST00000134089 1904 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
5730596B20RikQ8BQ08 Kcne2-201ENSMUST00000047383 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
5730596B20RikQ8BQ08 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
5730596B20RikQ8BQ08 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
5730596B20RikQ8BQ08 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
5730596B20RikQ8BQ08 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
5730596B20RikQ8BQ08 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
5730596B20RikQ8BQ08 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
5730596B20RikQ8BQ08 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
5730596B20RikQ8BQ08 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
5730596B20RikQ8BQ08 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
5730596B20RikQ8BQ08 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.34□□□□□ -0.43
5730596B20RikQ8BQ08 Gm42478-201ENSMUST00000199252 1467 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
5730596B20RikQ8BQ08 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.43
5730596B20RikQ8BQ08 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
5730596B20RikQ8BQ08 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
5730596B20RikQ8BQ08 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
5730596B20RikQ8BQ08 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
5730596B20RikQ8BQ08 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
5730596B20RikQ8BQ08 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
5730596B20RikQ8BQ08 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
5730596B20RikQ8BQ08 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
5730596B20RikQ8BQ08 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
5730596B20RikQ8BQ08 Gm1330-202ENSMUST00000109942 555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
5730596B20RikQ8BQ08 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
5730596B20RikQ8BQ08 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC12.33□□□□□ -0.44
5730596B20RikQ8BQ08 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
5730596B20RikQ8BQ08 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
5730596B20RikQ8BQ08 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
5730596B20RikQ8BQ08 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
5730596B20RikQ8BQ08 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
5730596B20RikQ8BQ08 Vmn1r35-201ENSMUST00000071414 891 ntAPPRIS P1 BASIC12.33□□□□□ -0.44
5730596B20RikQ8BQ08 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
5730596B20RikQ8BQ08 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
5730596B20RikQ8BQ08 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
5730596B20RikQ8BQ08 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
5730596B20RikQ8BQ08 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
5730596B20RikQ8BQ08 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
5730596B20RikQ8BQ08 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
5730596B20RikQ8BQ08 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
5730596B20RikQ8BQ08 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
5730596B20RikQ8BQ08 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
5730596B20RikQ8BQ08 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
5730596B20RikQ8BQ08 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
5730596B20RikQ8BQ08 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
5730596B20RikQ8BQ08 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
5730596B20RikQ8BQ08 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
5730596B20RikQ8BQ08 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.32□□□□□ -0.44
5730596B20RikQ8BQ08 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
5730596B20RikQ8BQ08 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
5730596B20RikQ8BQ08 Gm2030-201ENSMUST00000119590 1129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
5730596B20RikQ8BQ08 Gm15929-201ENSMUST00000138926 1161 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
5730596B20RikQ8BQ08 9530003J23Rik-202ENSMUST00000159193 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
5730596B20RikQ8BQ08 Gm37228-201ENSMUST00000193574 331 ntTSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
5730596B20RikQ8BQ08 Gm37973-201ENSMUST00000195767 1289 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
5730596B20RikQ8BQ08 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC12.32□□□□□ -0.44
5730596B20RikQ8BQ08 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
5730596B20RikQ8BQ08 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 94.6 ms