Protein–RNA interactions for Protein: Q80YF6

Upk3b, Uroplakin-3b, mousemouse

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Length 275 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Upk3bQ80YF6 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Upk3bQ80YF6 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Upk3bQ80YF6 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Upk3bQ80YF6 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Upk3bQ80YF6 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Upk3bQ80YF6 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Upk3bQ80YF6 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Upk3bQ80YF6 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Upk3bQ80YF6 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Upk3bQ80YF6 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Upk3bQ80YF6 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Upk3bQ80YF6 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Upk3bQ80YF6 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Upk3bQ80YF6 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Upk3bQ80YF6 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Upk3bQ80YF6 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Upk3bQ80YF6 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Upk3bQ80YF6 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Upk3bQ80YF6 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Upk3bQ80YF6 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Upk3bQ80YF6 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Upk3bQ80YF6 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Upk3bQ80YF6 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Upk3bQ80YF6 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Upk3bQ80YF6 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Upk3bQ80YF6 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Upk3bQ80YF6 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Upk3bQ80YF6 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Upk3bQ80YF6 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Upk3bQ80YF6 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Upk3bQ80YF6 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Upk3bQ80YF6 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Upk3bQ80YF6 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Upk3bQ80YF6 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Upk3bQ80YF6 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Upk3bQ80YF6 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Upk3bQ80YF6 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Upk3bQ80YF6 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Upk3bQ80YF6 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Upk3bQ80YF6 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Upk3bQ80YF6 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Upk3bQ80YF6 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Upk3bQ80YF6 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Upk3bQ80YF6 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Upk3bQ80YF6 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Upk3bQ80YF6 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Upk3bQ80YF6 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Upk3bQ80YF6 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Upk3bQ80YF6 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Upk3bQ80YF6 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Upk3bQ80YF6 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Upk3bQ80YF6 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Upk3bQ80YF6 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Upk3bQ80YF6 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Upk3bQ80YF6 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Upk3bQ80YF6 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Upk3bQ80YF6 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Upk3bQ80YF6 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Upk3bQ80YF6 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Upk3bQ80YF6 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Upk3bQ80YF6 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Upk3bQ80YF6 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Upk3bQ80YF6 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Upk3bQ80YF6 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Upk3bQ80YF6 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Upk3bQ80YF6 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Upk3bQ80YF6 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Upk3bQ80YF6 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Upk3bQ80YF6 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Upk3bQ80YF6 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Upk3bQ80YF6 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Upk3bQ80YF6 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Upk3bQ80YF6 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Upk3bQ80YF6 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Upk3bQ80YF6 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Upk3bQ80YF6 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Upk3bQ80YF6 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Upk3bQ80YF6 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Upk3bQ80YF6 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Upk3bQ80YF6 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Upk3bQ80YF6 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Upk3bQ80YF6 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Upk3bQ80YF6 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Upk3bQ80YF6 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Upk3bQ80YF6 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Upk3bQ80YF6 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Upk3bQ80YF6 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Upk3bQ80YF6 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Upk3bQ80YF6 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Upk3bQ80YF6 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Upk3bQ80YF6 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Upk3bQ80YF6 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Upk3bQ80YF6 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Upk3bQ80YF6 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Upk3bQ80YF6 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Upk3bQ80YF6 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Upk3bQ80YF6 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Upk3bQ80YF6 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Upk3bQ80YF6 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Upk3bQ80YF6 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 296 ms