Protein–RNA interactions for Protein: Q80U56

Avl9, Late secretory pathway protein AVL9 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 649 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Avl9Q80U56 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Avl9Q80U56 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Avl9Q80U56 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Avl9Q80U56 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Avl9Q80U56 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Avl9Q80U56 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Avl9Q80U56 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Avl9Q80U56 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Avl9Q80U56 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Avl9Q80U56 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Avl9Q80U56 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Avl9Q80U56 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Avl9Q80U56 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Avl9Q80U56 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Avl9Q80U56 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Avl9Q80U56 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Avl9Q80U56 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Avl9Q80U56 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Avl9Q80U56 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Avl9Q80U56 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Avl9Q80U56 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Avl9Q80U56 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Avl9Q80U56 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Avl9Q80U56 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Avl9Q80U56 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Avl9Q80U56 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Avl9Q80U56 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Avl9Q80U56 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Avl9Q80U56 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Avl9Q80U56 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Avl9Q80U56 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Avl9Q80U56 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Avl9Q80U56 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Avl9Q80U56 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Avl9Q80U56 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Avl9Q80U56 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Avl9Q80U56 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Avl9Q80U56 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Avl9Q80U56 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Avl9Q80U56 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Avl9Q80U56 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Avl9Q80U56 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Avl9Q80U56 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Avl9Q80U56 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Avl9Q80U56 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Avl9Q80U56 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Avl9Q80U56 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Avl9Q80U56 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Avl9Q80U56 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Avl9Q80U56 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Avl9Q80U56 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Avl9Q80U56 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Avl9Q80U56 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Avl9Q80U56 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Avl9Q80U56 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Avl9Q80U56 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Avl9Q80U56 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Avl9Q80U56 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Avl9Q80U56 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Avl9Q80U56 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Avl9Q80U56 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Avl9Q80U56 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Avl9Q80U56 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Avl9Q80U56 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Avl9Q80U56 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Avl9Q80U56 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Avl9Q80U56 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Avl9Q80U56 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Avl9Q80U56 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Avl9Q80U56 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Avl9Q80U56 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Avl9Q80U56 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Avl9Q80U56 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Avl9Q80U56 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Avl9Q80U56 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Avl9Q80U56 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Avl9Q80U56 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Avl9Q80U56 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Avl9Q80U56 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Avl9Q80U56 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Avl9Q80U56 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Avl9Q80U56 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Avl9Q80U56 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Avl9Q80U56 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Avl9Q80U56 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Avl9Q80U56 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Avl9Q80U56 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Avl9Q80U56 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Avl9Q80U56 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Avl9Q80U56 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Avl9Q80U56 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Avl9Q80U56 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Avl9Q80U56 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Avl9Q80U56 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Avl9Q80U56 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Avl9Q80U56 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
Avl9Q80U56 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Avl9Q80U56 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
Avl9Q80U56 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Avl9Q80U56 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.7 ms