Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSF0

Dsg1c, Desmoglein-1-gamma, mousemouse

Predictions only

Length 911 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dsg1cQ7TSF0 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Dsg1cQ7TSF0 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Dsg1cQ7TSF0 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Dsg1cQ7TSF0 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Dsg1cQ7TSF0 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Dsg1cQ7TSF0 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Dsg1cQ7TSF0 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Dsg1cQ7TSF0 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Dsg1cQ7TSF0 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Dsg1cQ7TSF0 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Dsg1cQ7TSF0 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Dsg1cQ7TSF0 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Dsg1cQ7TSF0 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Dsg1cQ7TSF0 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Dsg1cQ7TSF0 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Dsg1cQ7TSF0 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Dsg1cQ7TSF0 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Dsg1cQ7TSF0 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Dsg1cQ7TSF0 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Dsg1cQ7TSF0 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Dsg1cQ7TSF0 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Dsg1cQ7TSF0 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Dsg1cQ7TSF0 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Dsg1cQ7TSF0 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Dsg1cQ7TSF0 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Dsg1cQ7TSF0 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Dsg1cQ7TSF0 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Dsg1cQ7TSF0 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Dsg1cQ7TSF0 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Dsg1cQ7TSF0 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Dsg1cQ7TSF0 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Dsg1cQ7TSF0 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Dsg1cQ7TSF0 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Dsg1cQ7TSF0 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Dsg1cQ7TSF0 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Dsg1cQ7TSF0 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Dsg1cQ7TSF0 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Dsg1cQ7TSF0 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Dsg1cQ7TSF0 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Dsg1cQ7TSF0 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Dsg1cQ7TSF0 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Dsg1cQ7TSF0 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Dsg1cQ7TSF0 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Dsg1cQ7TSF0 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Dsg1cQ7TSF0 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Dsg1cQ7TSF0 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Dsg1cQ7TSF0 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Dsg1cQ7TSF0 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Dsg1cQ7TSF0 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Dsg1cQ7TSF0 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Dsg1cQ7TSF0 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Dsg1cQ7TSF0 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Dsg1cQ7TSF0 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Dsg1cQ7TSF0 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Dsg1cQ7TSF0 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Dsg1cQ7TSF0 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Dsg1cQ7TSF0 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Dsg1cQ7TSF0 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Dsg1cQ7TSF0 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Dsg1cQ7TSF0 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Dsg1cQ7TSF0 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Dsg1cQ7TSF0 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Dsg1cQ7TSF0 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Dsg1cQ7TSF0 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Dsg1cQ7TSF0 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Dsg1cQ7TSF0 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Dsg1cQ7TSF0 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Dsg1cQ7TSF0 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Dsg1cQ7TSF0 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Dsg1cQ7TSF0 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Dsg1cQ7TSF0 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Dsg1cQ7TSF0 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Dsg1cQ7TSF0 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Dsg1cQ7TSF0 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Dsg1cQ7TSF0 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Dsg1cQ7TSF0 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Dsg1cQ7TSF0 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Dsg1cQ7TSF0 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Dsg1cQ7TSF0 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Dsg1cQ7TSF0 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Dsg1cQ7TSF0 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Dsg1cQ7TSF0 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Dsg1cQ7TSF0 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Dsg1cQ7TSF0 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Dsg1cQ7TSF0 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Dsg1cQ7TSF0 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Dsg1cQ7TSF0 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Dsg1cQ7TSF0 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Dsg1cQ7TSF0 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Dsg1cQ7TSF0 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Dsg1cQ7TSF0 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Dsg1cQ7TSF0 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Dsg1cQ7TSF0 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Dsg1cQ7TSF0 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Dsg1cQ7TSF0 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Dsg1cQ7TSF0 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Dsg1cQ7TSF0 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Dsg1cQ7TSF0 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Dsg1cQ7TSF0 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Dsg1cQ7TSF0 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.5 ms