Protein–RNA interactions for Protein: Q7TS74

Ckap2l, Cytoskeleton-associated protein 2-like, mousemouse

Predictions only

Length 745 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ckap2lQ7TS74 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ckap2lQ7TS74 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ckap2lQ7TS74 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ckap2lQ7TS74 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ckap2lQ7TS74 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ckap2lQ7TS74 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ckap2lQ7TS74 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ckap2lQ7TS74 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ckap2lQ7TS74 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ckap2lQ7TS74 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ckap2lQ7TS74 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ckap2lQ7TS74 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ckap2lQ7TS74 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ckap2lQ7TS74 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ckap2lQ7TS74 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ckap2lQ7TS74 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ckap2lQ7TS74 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ckap2lQ7TS74 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ckap2lQ7TS74 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ckap2lQ7TS74 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ckap2lQ7TS74 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ckap2lQ7TS74 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ckap2lQ7TS74 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Ckap2lQ7TS74 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ckap2lQ7TS74 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ckap2lQ7TS74 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ckap2lQ7TS74 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ckap2lQ7TS74 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ckap2lQ7TS74 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ckap2lQ7TS74 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ckap2lQ7TS74 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ckap2lQ7TS74 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ckap2lQ7TS74 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ckap2lQ7TS74 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ckap2lQ7TS74 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Ckap2lQ7TS74 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Ckap2lQ7TS74 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ckap2lQ7TS74 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ckap2lQ7TS74 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Ckap2lQ7TS74 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC18.02■□□□□ 0.47
Ckap2lQ7TS74 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Ckap2lQ7TS74 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ckap2lQ7TS74 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ckap2lQ7TS74 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ckap2lQ7TS74 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ckap2lQ7TS74 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ckap2lQ7TS74 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ckap2lQ7TS74 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ckap2lQ7TS74 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ckap2lQ7TS74 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ckap2lQ7TS74 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ckap2lQ7TS74 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ckap2lQ7TS74 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ckap2lQ7TS74 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ckap2lQ7TS74 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Ckap2lQ7TS74 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ckap2lQ7TS74 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Ckap2lQ7TS74 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ckap2lQ7TS74 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ckap2lQ7TS74 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Ckap2lQ7TS74 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ckap2lQ7TS74 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ckap2lQ7TS74 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ckap2lQ7TS74 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ckap2lQ7TS74 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Ckap2lQ7TS74 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Ckap2lQ7TS74 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Ckap2lQ7TS74 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ckap2lQ7TS74 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
Ckap2lQ7TS74 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Ckap2lQ7TS74 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ckap2lQ7TS74 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ckap2lQ7TS74 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ckap2lQ7TS74 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ckap2lQ7TS74 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ckap2lQ7TS74 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Ckap2lQ7TS74 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Ckap2lQ7TS74 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ckap2lQ7TS74 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ckap2lQ7TS74 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ckap2lQ7TS74 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Ckap2lQ7TS74 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ckap2lQ7TS74 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ckap2lQ7TS74 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ckap2lQ7TS74 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ckap2lQ7TS74 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ckap2lQ7TS74 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ckap2lQ7TS74 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ckap2lQ7TS74 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ckap2lQ7TS74 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ckap2lQ7TS74 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ckap2lQ7TS74 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ckap2lQ7TS74 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ckap2lQ7TS74 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Ckap2lQ7TS74 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ckap2lQ7TS74 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ckap2lQ7TS74 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ckap2lQ7TS74 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ckap2lQ7TS74 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ckap2lQ7TS74 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.1 ms