Protein–RNA interactions for Protein: Q78YZ6

Scoc, Short coiled-coil protein, mousemouse

Predictions only

Length 125 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ScocQ78YZ6 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ScocQ78YZ6 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ScocQ78YZ6 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ScocQ78YZ6 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ScocQ78YZ6 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ScocQ78YZ6 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ScocQ78YZ6 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ScocQ78YZ6 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ScocQ78YZ6 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
ScocQ78YZ6 Cdh11-201ENSMUST00000075190 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
ScocQ78YZ6 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
ScocQ78YZ6 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
ScocQ78YZ6 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
ScocQ78YZ6 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
ScocQ78YZ6 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
ScocQ78YZ6 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
ScocQ78YZ6 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
ScocQ78YZ6 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
ScocQ78YZ6 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
ScocQ78YZ6 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
ScocQ78YZ6 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
ScocQ78YZ6 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
ScocQ78YZ6 Zfp334-201ENSMUST00000103084 8205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
ScocQ78YZ6 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
ScocQ78YZ6 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
ScocQ78YZ6 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
ScocQ78YZ6 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
ScocQ78YZ6 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
ScocQ78YZ6 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
ScocQ78YZ6 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
ScocQ78YZ6 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
ScocQ78YZ6 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
ScocQ78YZ6 Shank3-201ENSMUST00000039074 7131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
ScocQ78YZ6 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
ScocQ78YZ6 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
ScocQ78YZ6 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
ScocQ78YZ6 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
ScocQ78YZ6 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
ScocQ78YZ6 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
ScocQ78YZ6 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
ScocQ78YZ6 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
ScocQ78YZ6 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
ScocQ78YZ6 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
ScocQ78YZ6 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
ScocQ78YZ6 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
ScocQ78YZ6 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
ScocQ78YZ6 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
ScocQ78YZ6 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
ScocQ78YZ6 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
ScocQ78YZ6 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
ScocQ78YZ6 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
ScocQ78YZ6 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
ScocQ78YZ6 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
ScocQ78YZ6 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
ScocQ78YZ6 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
ScocQ78YZ6 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
ScocQ78YZ6 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
ScocQ78YZ6 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
ScocQ78YZ6 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
ScocQ78YZ6 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
ScocQ78YZ6 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
ScocQ78YZ6 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
ScocQ78YZ6 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
ScocQ78YZ6 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
ScocQ78YZ6 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
ScocQ78YZ6 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
ScocQ78YZ6 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
ScocQ78YZ6 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
ScocQ78YZ6 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
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ScocQ78YZ6 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
ScocQ78YZ6 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
ScocQ78YZ6 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
ScocQ78YZ6 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
ScocQ78YZ6 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
ScocQ78YZ6 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
ScocQ78YZ6 Cacnb4-201ENSMUST00000078324 8225 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
ScocQ78YZ6 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
ScocQ78YZ6 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
ScocQ78YZ6 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
ScocQ78YZ6 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
ScocQ78YZ6 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
ScocQ78YZ6 Ptprt-202ENSMUST00000109442 7719 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
ScocQ78YZ6 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
ScocQ78YZ6 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
ScocQ78YZ6 Btaf1-201ENSMUST00000099494 7204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
ScocQ78YZ6 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
ScocQ78YZ6 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
ScocQ78YZ6 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
ScocQ78YZ6 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
ScocQ78YZ6 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
ScocQ78YZ6 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
ScocQ78YZ6 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
ScocQ78YZ6 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
ScocQ78YZ6 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
ScocQ78YZ6 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
ScocQ78YZ6 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
ScocQ78YZ6 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
ScocQ78YZ6 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
ScocQ78YZ6 Lrp4-201ENSMUST00000028689 7926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
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