Protein–RNA interactions for Protein: Q78JN3

Eci3, Enoyl-CoA delta isomerase 3, peroxisomal, mousemouse

Predictions only

Length 317 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Eci3Q78JN3 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Eci3Q78JN3 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Eci3Q78JN3 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Eci3Q78JN3 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Eci3Q78JN3 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Eci3Q78JN3 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Eci3Q78JN3 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Eci3Q78JN3 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Eci3Q78JN3 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Eci3Q78JN3 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Eci3Q78JN3 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Eci3Q78JN3 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Eci3Q78JN3 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Eci3Q78JN3 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Eci3Q78JN3 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Eci3Q78JN3 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Eci3Q78JN3 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Eci3Q78JN3 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Eci3Q78JN3 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Eci3Q78JN3 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Eci3Q78JN3 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Eci3Q78JN3 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Eci3Q78JN3 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Eci3Q78JN3 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Eci3Q78JN3 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Eci3Q78JN3 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Eci3Q78JN3 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Eci3Q78JN3 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Eci3Q78JN3 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Eci3Q78JN3 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Eci3Q78JN3 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Eci3Q78JN3 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Eci3Q78JN3 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Eci3Q78JN3 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Eci3Q78JN3 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Eci3Q78JN3 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Eci3Q78JN3 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Eci3Q78JN3 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Eci3Q78JN3 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Eci3Q78JN3 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Eci3Q78JN3 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Eci3Q78JN3 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Eci3Q78JN3 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Eci3Q78JN3 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Eci3Q78JN3 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Eci3Q78JN3 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Eci3Q78JN3 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Eci3Q78JN3 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Eci3Q78JN3 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Eci3Q78JN3 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Eci3Q78JN3 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Eci3Q78JN3 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Eci3Q78JN3 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Eci3Q78JN3 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Eci3Q78JN3 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Eci3Q78JN3 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Eci3Q78JN3 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Eci3Q78JN3 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Eci3Q78JN3 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Eci3Q78JN3 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Eci3Q78JN3 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Eci3Q78JN3 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Eci3Q78JN3 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Eci3Q78JN3 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Eci3Q78JN3 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Eci3Q78JN3 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Eci3Q78JN3 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Eci3Q78JN3 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Eci3Q78JN3 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Eci3Q78JN3 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Eci3Q78JN3 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Eci3Q78JN3 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Eci3Q78JN3 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Eci3Q78JN3 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Eci3Q78JN3 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Eci3Q78JN3 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Eci3Q78JN3 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Eci3Q78JN3 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Eci3Q78JN3 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Eci3Q78JN3 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Eci3Q78JN3 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Eci3Q78JN3 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Eci3Q78JN3 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Eci3Q78JN3 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Eci3Q78JN3 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Eci3Q78JN3 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Eci3Q78JN3 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Eci3Q78JN3 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Eci3Q78JN3 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Eci3Q78JN3 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Eci3Q78JN3 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Eci3Q78JN3 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Eci3Q78JN3 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Eci3Q78JN3 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Eci3Q78JN3 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Eci3Q78JN3 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Eci3Q78JN3 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Eci3Q78JN3 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Eci3Q78JN3 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Eci3Q78JN3 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.2 ms